河北农业大学：《功能基因组学》课程教学资源（PPT课件）第三讲 遗传作图

第四章遗传作图

本章主要内容： ▪ 第一节 遗传作图基本概念 ▪ 第二节 遗传作图的分子标记 ▪ 第三节 遗传作图的方法

本章主要内容： ▪ 第一节 遗传作图基本概念 ▪ 第二节 遗传作图的分子标记 ▪ 第三节 遗传作图的方法

第一节 遗传作图基本概念 1. 遗传作图定义 采用遗传学分析方法将基因或其他DNA 顺序标定在染色体上构建连锁图。 2. 遗传作图的基本原理 随机的染色体上两个任意基因座越远， 它们越容易被染色体断裂所分离

第一节 遗传作图基本概念 1. 遗传作图定义 采用遗传学分析方法将基因或其他DNA 顺序标定在染色体上构建连锁图。 2. 遗传作图的基本原理 随机的染色体上两个任意基因座越远， 它们越容易被染色体断裂所分离

3.遗传图距的单位 厘摩（cM）:每单位厘摩为1％交换率。 交换率或交换值或重组频率= 减数分裂的重组产物\减数分裂的总产物 4.遗传作图的主要方法 杂交实验、 家系分析

3.遗传图距的单位 厘摩（cM）:每单位厘摩为1％交换率。 交换率或交换值或重组频率= 减数分裂的重组产物\减数分裂的总产物 4.遗传作图的主要方法 杂交实验、 家系分析

第二节 遗传作图标记 1. 基因标记 孟德尔 — 肉眼→ 豌豆植株高矮、豌豆颜 色等 摩尔根 — 显微镜、肉眼→ 果蝇躯体颜色、 翅膀形状等 生化表型→细菌、酵母遗传学研究；人类 中如血型系列（ABO）分析、血清蛋白 和免疫蛋白

第二节 遗传作图标记 1. 基因标记 孟德尔 — 肉眼→ 豌豆植株高矮、豌豆颜 色等 摩尔根 — 显微镜、肉眼→ 果蝇躯体颜色、 翅膀形状等 生化表型→细菌、酵母遗传学研究；人类 中如血型系列（ABO）分析、血清蛋白 和免疫蛋白

基因标记的缺点 高等生物，如 脊椎动物和显花植物等，可 用作标记的基因十分有限，许多性状都涉及 多基因； 高等生物基因组中存在大量的基因间隔区， 纯粹用基因作为标记将在遗传图谱中留下大 片的无标记区段； 只有部分基因其等位基因成员可以通过常规 试验予以区分，因而产生的遗传图是不完整 的，必需寻找其他有效的标记；

基因标记的缺点 高等生物，如 脊椎动物和显花植物等，可 用作标记的基因十分有限，许多性状都涉及 多基因； 高等生物基因组中存在大量的基因间隔区， 纯粹用基因作为标记将在遗传图谱中留下大 片的无标记区段； 只有部分基因其等位基因成员可以通过常规 试验予以区分，因而产生的遗传图是不完整 的，必需寻找其他有效的标记；

2. DNA分子标记 2.1 DNA 分子标记作图的优点: 不以表型为参照 直接检测个体基因型组成 具有共显性的特点

2. DNA分子标记 2.1 DNA 分子标记作图的优点: 不以表型为参照 直接检测个体基因型组成 具有共显性的特点

2.2 分子标记用于基因定位的发展史 基因定位最早采用的方法就是连锁分析。 通过基因与DNA标记之间的重组率来估计基因 的位置。可用于连锁分析的DNA标志是基因定 位的基础，DNA标记越多，杂合性越强，基因 定位就越方便。DNA标记的选择经历了从 RFLP-STR－SNP等发展过程。 PIC(polymorphic formation content):某一标记 在群体中出现多态性的频率

2.2 分子标记用于基因定位的发展史 基因定位最早采用的方法就是连锁分析。 通过基因与DNA标记之间的重组率来估计基因 的位置。可用于连锁分析的DNA标志是基因定 位的基础，DNA标记越多，杂合性越强，基因 定位就越方便。DNA标记的选择经历了从 RFLP-STR－SNP等发展过程。 PIC(polymorphic formation content):某一标记 在群体中出现多态性的频率

183个RFLP, 多态性不够高，杂合性（PIC）平均达 到 0 .3而且在染色体上分布不均匀，难以将一些罕 见的基因进行定位；对多基因病的定位也难以奏效, STR位点已经达到8000个，平均100kb－200kb有 一个 STR位点，杂合性（PIC）平均达到0 .7, 这已经使得连锁分析的功能发挥到了极限。 SNP位点已经达到数十万个，平均 1000bp有 一个 ，估计1700万个(40个人筛选结果）。 (短串联重复序列,STRs ,short tendem repeats)

183个RFLP, 多态性不够高，杂合性（PIC）平均达 到 0 .3而且在染色体上分布不均匀，难以将一些罕 见的基因进行定位；对多基因病的定位也难以奏效, STR位点已经达到8000个，平均100kb－200kb有 一个 STR位点，杂合性（PIC）平均达到0 .7, 这已经使得连锁分析的功能发挥到了极限。 SNP位点已经达到数十万个，平均 1000bp有 一个 ，估计1700万个(40个人筛选结果）。 (短串联重复序列,STRs ,short tendem repeats)

2.3 分子标记 ▪ RFLP(restriction fragment length polymorphisms,限制性片段长度多态性)

2.3 分子标记 ▪ RFLP(restriction fragment length polymorphisms,限制性片段长度多态性)