《生物化学》课程教学课件(PPT讲稿)第四章 蛋白质(蛋白质的结构与功能)第二节 蛋白质的二级结构(secondary structure)1/4

第二节蛋白质的二级结构 (secondary structure) 、蛋白质二级结构定义 指多肽链借助氢键排列成沿一维方向 具有周期性结构的构象
第二节 蛋白质的二级结构 (secondary structure) 一、蛋白质二级结构定义 指多肽链借助氢键排列成沿一维方向 具有周期性结构的构象

二、研究蛋白质构象的方法 (一)X-射线衍射技术(X-ray diffraction method) X-射线(λ=0.154nm) 蛋白质晶体(0.5mm) 原子水平
二、研究蛋白质构象的方法 (一) X-射线衍射技术(X-ray diffraction method) X-射线( = 0.154nm) 蛋白质晶体(0.5 mm) 原子水平

A0243801.moW

(二)核磁共振 (Nuclear magnetic resonance,NMR) 在原子水平,蛋白质溶液 蛋白质浓度(15mg/ml)
(二)核磁共振 (Nuclear magnetic resonance,NMR) 在原子水平,蛋白质溶液 蛋白质浓度(15 mg/ml)

三、多肽链折叠的空间限制 (一)二面角(dihedral angle)
三、多肽链折叠的空间限制 (一)二面角(dihedral angle)

H H (d)

在多肽链的主链结构中,与Cα相连的两 个单键可绕键轴旋转,其中N一C单键的 旋转角度用b表示,Cc一C单键的旋转角 度用y表示。这两个旋转角度叫二面角。 一对二面角决定了相邻两个肽单位的构象
在多肽链的主链结构中,与C相连的两 个单键可绕键轴旋转,其中N-C单键的 旋转角度用 表示,C-C单键的旋转角 度用 表示。这两个旋转角度叫二面角。 一对二面角决定了相邻两个肽单位的构象

(二)Ramachandran构象图 理论推测 依据: 非键合原子之间的接触距离(范德华半径)
(二)Ramachandran 构象图 理论推测 依据: 非键合原子之间的接触距离(范德华半径)

M29X9K0 Collagen triple helix Antiparallel B sheets Parallel B sheets Right-twisted B sheets +180 120 60 -60 -120 -180 -180 0 +180 中(degrees) Right-handed Left-handed a helix a helix

用作横坐标,y作纵坐标,作图表示哪 些成对二面角所规定的两个相邻肽单位的 构象是允许的,哪些是不允许的,这个·一 y图,就是Ramachandran构象图 从该图可以看出,肽链的折叠具有相当大 的局限性
用作横坐标, 作纵坐标, 作图表示哪 些成对二面角所规定的两个相邻肽单位的 构象是允许的,哪些是不允许的,这个 - 图,就是Ramachandran 构象图 从该图可以看出,肽链的折叠具有相当大 的局限性
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