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《农业微生物学》课程授课教案(讲义)第十章 微生物在自然界物质循环中的作用

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第一节 碳素循环 (carbon cycle) 第二节 氮素循环 (nitrogen cycle) 第三节 硫、磷等矿质元素的转化
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第十章微生物在自然界物质循环中的作用 自然界中的物质处于不停的循环之中,这是生物生存的前提条件,也符合物 质守恒定律。 随着地质条件和地质年代的变迁,地球上的各种化学元素的转变表现为从陆 地冲刷到海洋,最后又经地壳的升降运动,从海洋上升为陆地的地质大循环。 在一个有限的环境中,主要是土壤、空气、水等生态环境中的碳、氢、氧 氮、硫、磷、铁、锰、钾、钙等营养元素将为生物所利用,生物只有不断地从环 境中获取这些元素才能生长、发育和繁殖。但地球上这些元素特别是能被有效利 用的部分的贮存量终究是有限的,而生命的延续和发展却是无尽的。这一供求矛 盾只有在营养元素的不断循环中才能得以解,这就是营养元素的生物小循环。 生物小循环是生物所推动的自然界物质循环,主要包括:生物合成作用,有 机质的矿化或分解作用,无机物的转化作用,生物小循环可分解为各种元素的循 环。 微生物与动植物一样积极参与了生物小循环,其作用可归纳为5个方面: ◆有机物的主要分解者(异养微生物通过不同的代谢途径和方式将动 植物残体、分泌物、排泄物等有机质分解为简单的无机物一一矿化 作用,供初级生产者再利用。) ◆增加无机矿质元素的有效性 ◆生物固氮(在氮素循环中起重要作用) ◆生态系统食物链的初级生产者(光合微生物和化能自养菌) ◆物质和能量的储存者(在地球生态系统中,常有部分生物或其残体 由于地壳运动脱离生物小循环进入地质大循环,在缺氧、高压等特殊地质条件下, 经过漫长的转化,逐步转变为煤、石油、天然气等。) 第一节碳素循环(carbon cycle) 碳元素是一种重要的元素,是构成生物细胞的骨架物质,约占细胞干重的 40~50%,因此碳循环是最重要的物质循环。自然界的碳素循环如图所示:

第十章微生物在自然界物质循环中的作用 自然界中的物质处于不停的循环之中,这是生物生存的前提条件,也符合物 质守恒定律。 随着地质条件和地质年代的变迁,地球上的各种化学元素的转变表现为从陆 地冲刷到海洋,最后又经地壳的升降运动,从海洋上升为陆地的地质大循环。 在一个有限的环境中,主要是土壤、空气、水等生态环境中的碳、氢、氧、 氮、硫、磷、铁、锰、钾、钙等营养元素将为生物所利用,生物只有不断地从环 境中获取这些元素才能生长、发育和繁殖。但地球上这些元素特别是能被有效利 用的部分的贮存量终究是有限的,而生命的延续和发展却是无尽的。这一供求矛 盾只有在营养元素的不断循环中才能得以解,这就是营养元素的生物小循环。 生物小循环是生物所推动的自然界物质循环,主要包括:生物合成作用,有 机质的矿化或分解作用,无机物的转化作用,生物小循环可分解为各种元素的循 环。 微生物与动植物一样积极参与了生物小循环,其作用可归纳为 5 个方面: ◆ 有机物的主要分解者(异养微生物通过不同的代谢途径和方式将动 植物残体、分泌物、排泄物等有机质分解为简单的无机物——矿化 作用,供初级生产者再利用。) ◆ 增加无机矿质元素的有效性 ◆ 生物固氮(在氮素循环中起重要作用) ◆ 生态系统食物链的初级生产者(光合微生物和化能自养菌) ◆ 物质和能量的储存者(在地球生态系统中,常有部分生物或其残体 由于地壳运动脱离生物小循环进入地质大循环,在缺氧、高压等特殊地质条件下, 经过漫长的转化,逐步转变为煤、石油、天然气等。) 第一节 碳素循环 (carbon cycle) 碳元素是一种重要的元素,是构成生物细胞的骨架物质,约占细胞干重的 40~50%,因此碳循环是最重要的物质循环。自然界的碳素循环如图所示:

有机碳化物 腐妇 动 植物和徽生物 蓝细菌、光合细菌和绿色植物通过光合作用吸收固定00,进而合成有机碳 化物:光合微生物和植物在合成有机物的同时,通过呼吸、发酵等途径将部分有 机物降解获得能量和中间代谢物,亦将一部分C0,归还于空气:植物和微生物积 累的有机物一部分为动物所利用,通过动物呼吸将一部分有机碳分解为C02:植 物、动物残体被微生物分解转化,使C0重新进入循环。 可见微生物既参与了C0:的固定,也参与了C0,的再生。 1.微生物在C0固定中的作用: ◆产氧的光合作用:藻类、蓝细菌 ◆不产氧的光合作用: 光合细菌(有光、厌氧、有HS等还原物存在 时,如,绿硫细菌) ◆氧化无机物产能:化能自养菌(利用无机物氧化释放的能量固定 C0,如硫化细菌,铁细菌,硝化细菌,氢细菌) ◆甲烷的形成与转化:甲烷产生菌(能在厌氧条件下利用简单的有机 物或将C0还原为甲烷,甲烷又可作为甲基营养菌的碳源,氧化成 C02) 2.微生物在有机物分解中的作用: 死亡动、植物和微生物残体中有机物的转化和分解主要靠异养微生物。 例如: 糖类,有机酸:由好氧微生物彻底氧化分解为C0,和水:

蓝细菌、光合细菌和绿色植物通过光合作用吸收固定 CO2,进而合成有机碳 化物;光合微生物和植物在合成有机物的同时,通过呼吸、发酵等途径将部分有 机物降解获得能量和中间代谢物,亦将一部分 CO2归还于空气;植物和微生物积 累的有机物一部分为动物所利用,通过动物呼吸将一部分有机碳分解为 CO2;植 物、动物残体被微生物分解转化,使 CO2重新进入循环。 可见微生物既参与了 CO2 的固定,也参与了 CO2的再生。 1. 微生物在 CO2固定中的作用: ◆ 产氧的光合作用: 藻类、蓝细菌 ◆ 不产氧的光合作用: 光合细菌(有光、厌氧、有 H2S 等还原物存在 时,如,绿硫细菌) ◆ 氧化无机物产能: 化能自养菌(利用无机物氧化释放的能量固定 CO2,如硫化细菌,铁细菌,硝化细菌,氢细菌) ◆ 甲烷的形成与转化: 甲烷产生菌(能在厌氧条件下利用简单的有机 物或 H2将 CO2还原为甲烷,甲烷又可作为甲基营养菌的碳源,氧化成 CO2) 2. 微生物在有机物分解中的作用: 死亡动、植物和微生物残体中有机物的转化和分解主要靠异养微生物。 例如: 糖类,有机酸:由好氧微生物彻底氧化分解为 CO2和水;

纤维素等大分子:由微生物分泌的胞外酶降解为糖或简单有机物后才被微生 物吸收继续分解。 1)淀粉的分解: 淀粉主要来自植物,它是植物的重要贮藏物质。从化学结构上看,淀粉是由 葡萄糖通过糖苷键聚合而成的大分子,可细分为直链淀粉和支链淀粉。在直链淀 粉中,葡萄糖单元彼此以α-1,4-糖苷键连接。支链淀粉带有分支,其中的 葡萄糖单元除了以a-1,4糖苷键结合外,在直链与支链的交接处以ā-1, 6-糖苷键连接。在自然界,直链淀粉约占10%~20%,支链淀粉约占80%~90%。 淀粉是易被微生物利用的有机物质。 淀粉酶是一类水解淀粉糖苷键的酶,有如下4种: ā-淀粉酶(液化型淀粉酶):此酶是一种内切酶,能够水解淀粉分子内部的 a-1,4-糖苷键,但不能对a-1,,6-糖苷键以及靠近a-1,6-糖苷 键的ā-1,4糖苷键产生作用。产物为麦芽糖,带和不带支链的寡糖。 由于这些产物的构型均为ā一构型,故称为ā一淀粉酶。经过该酶的作用, 淀粉液的粘度下降,因而又称为液化型淀粉酶。 糖化型淀粉酶包括以下三种: B-淀粉酶(淀粉-1,4麦芽糖苷酶):产物为麦芽糖和极限糊精。 此酶是一种外切酶,能够从淀粉分子的非还原性末端开始,以双糖为单位, 逐步水解α-1,4-糖苷键,生成麦芽糖。但不能作用于淀粉分子中的a-1, 6-糖苷键,也不能越过a-1,6糖苷键去水解α-1,4糖苷键。在水 解过程中,遇到▣-1,6糖苷键即停止作用。它的水解产物是麦芽糖和极限 糊精。由于该酶的作用部位是B一位的糖苷键,故称为B一淀粉酶。 葡萄糖生成酶(淀粉一1,4葡萄糖苷酶):这种酶能够从淀粉的非还原性末 端开始,以葡萄糖为单位,依次水解α-1,4糖苷键,生成葡萄糖。产物为 萄萄糖和支链寡糖:如果被作用的底物是直链淀粉,则产物为葡萄糖(该酶由此 得名):如果被水解的底物是支链淀粉,其产物是葡萄糖和带有α-1,6-糖 苷键的支链寡糖。 异淀粉酶(淀粉-1,6-葡萄糖苷酶):水解α-1,6-糖苷键,产物为葡萄糖和糊

纤维素等大分子:由微生物分泌的胞外酶降解为糖或简单有机物后才被微生 物吸收继续分解。 1) 淀粉的分解: 淀粉主要来自植物,它是植物的重要贮藏物质。从化学结构上看,淀粉是由 葡萄糖通过糖苷键聚合而成的大分子,可细分为直链淀粉和支链淀粉。在直链淀 粉中,葡萄糖单元彼此以α -1 , 4- 糖苷键连接。支链淀粉带有分支,其中的 葡萄糖单元除了以α -1 ,4- 糖苷键结合外,在直链与支链的交接处以α -1 , 6- 糖苷键连接。在自然界,直链淀粉约占 10%~20% ,支链淀粉约占 80%~90% 。 淀粉是易被微生物利用的有机物质。 淀粉酶是一类水解淀粉糖苷键的酶,有如下 4 种: α-淀粉酶(液化型淀粉酶): 此酶是一种内切酶,能够水解淀粉分子内部的 α -1 , 4- 糖苷键,但不能对α -1 , 6- 糖苷键以及靠近α -1 , 6- 糖苷 键的α -1 , 4- 糖苷键产生作用。产物为麦芽糖,带和不带支链的寡糖。 由于这些产物的构型均为α - 构型,故称为α - 淀粉酶。经过该酶的作用, 淀粉液的粘度下降,因而又称为液化型淀粉酶。 糖化型淀粉酶包括以下三种: β-淀粉酶(淀粉-1,4-麦芽糖苷酶):产物为麦芽糖和极限糊精。 此酶是一种外切酶,能够从淀粉分子的非还原性末端开始,以双糖为单位, 逐步水解α -1 , 4- 糖苷键,生成麦芽糖。但不能作用于淀粉分子中的α -1 , 6- 糖苷键,也不能越过α -1 , 6- 糖苷键去水解α -1 , 4- 糖苷键。在水 解过程中,遇到α -1 , 6- 糖苷键即停止作用。它的水解产物是麦芽糖和极限 糊精。由于该酶的作用部位是β - 位的糖苷键,故称为β - 淀粉酶。 葡萄糖生成酶(淀粉-1,4-葡萄糖苷酶): 这种酶能够从淀粉的非还原性末 端开始,以葡萄糖为单位,依次水解α -1 , 4- 糖苷键,生成葡萄糖。产物为 葡萄糖和支链寡糖:如果被作用的底物是直链淀粉,则产物为葡萄糖(该酶由此 得名);如果被水解的底物是支链淀粉,其产物是葡萄糖和带有α -1 , 6- 糖 苷键的支链寡糖。 异淀粉酶(淀粉-1,6-葡萄糖苷酶):水解α-1,6-糖苷键,产物为葡萄糖和糊 精

能够利用淀粉的微生物种类很多。细菌中的枯草杆菌,真菌中的曲霉、根霉 和毛霉都是很强的淀粉分解菌。放线菌中的小单孢菌、诺卡氏菌和链莓菌也能分 解淀粉,但能力相对较弱。微生物分解淀粉的方式是:先分泌胞外淀粉酶,将淀 粉水解成双糖和单糖,然后再摄入体内利用。淀粉不能直接透过细胞膜,如没有 淀粉酶,微生物就不能利用淀粉。 淀粉分解菌(糖化菌)在食品发酵上有着广泛的应用。例如,在白酒生产中, 常用淀粉(如番薯干、大米等)作原料,总是先用糖化菌(如曲霉、毛磊、根毒) 将淀粉水解,然后再加酵母菌进行酒精发酵。如果没有糖化菌的水解作用,酵母 菌就不能进行酒精发酵,因为后者不能直接利用淀粉。 2)纤维素的分解 纤维素是植物细胞壁的主要成分,约占植物总重量的一半,是自然界最丰言 的有机化合物。与淀粉一样,纤维素也由葡萄糖单元聚合而成。两者的区别在于 淀粉以α-糖苷键连接,而纤维素则以B-1,4-糖苷键连接。此外,纤维素分 子比淀粉大,更难溶于水。 纤维素不能直接透过细胞质膜,只有在微生物合成的纤维素酶作用下,水解 成单糖后,才能被吸收至细胞内利用。纤维素酶有细胞表面酶和胞外酶两种。细 菌纤维素酶一般为细胞表面酶,位于细胞膜上,分解纤维素时,细菌必须附着在 纤维素表面。真菌和放线菌的纤维素酶为胞外酶,它们可以在胞外环境中起作用, 菌体无需直接与纤维素表面接触。 纤维素酶是多种作用于纤维素的酶的总称,它包括如下三种酶: ()、C:酶(内-B-葡聚糖酶)此酶主要水解纤维素分子内的B-糖 苷键,产生带有自由末端的长链片段。一种微生物能分泌一种以上的C,同功酶。 (②、Cx酶(外一B-葡聚糖酶)此酶作用于纤维素分子的末端,产生 纤维二糖。与C,酶一样,一种微生物也能分泌出多种结构不同而功能相同的C x酶。 (3③)、纤维二糖酶此酶能将纤维二糖水解成葡萄糖。 纤维酶对纤维素的水解过程可表示为: (C,Hn0以+0→C0+H0 (纤维素)9雨箱(纤维二得)8:面车餐东 (葡萄糖)

能够利用淀粉的微生物种类很多。细菌中的枯草杆菌,真菌中的曲霉、根霉 和毛霉都是很强的淀粉分解菌。放线菌中的小单孢菌、诺卡氏菌和链霉菌也能分 解淀粉,但能力相对较弱。微生物分解淀粉的方式是:先分泌胞外淀粉酶,将淀 粉水解成双糖和单糖,然后再摄入体内利用。淀粉不能直接透过细胞膜,如没有 淀粉酶,微生物就不能利用淀粉。 淀粉分解菌(糖化菌)在食品发酵上有着广泛的应用。例如,在白酒生产中, 常用淀粉(如番薯干、大米等)作原料,总是先用糖化菌(如曲霉、毛霉、根霉) 将淀粉水解,然后再加酵母菌进行酒精发酵。如果没有糖化菌的水解作用,酵母 菌就不能进行酒精发酵,因为后者不能直接利用淀粉。 2) 纤维素的分解 纤维素是植物细胞壁的主要成分,约占植物总重量的一半,是自然界最丰富 的有机化合物。与淀粉一样,纤维素也由葡萄糖单元聚合而成。两者的区别在于 淀粉以α - 糖苷键连接,而纤维素则以β-1,4- 糖苷键连接。此外,纤维素分 子比淀粉大,更难溶于水。 纤维素不能直接透过细胞质膜,只有在微生物合成的纤维素酶作用下,水解 成单糖后,才能被吸收至细胞内利用。纤维素酶有细胞表面酶和胞外酶两种。细 菌纤维素酶一般为细胞表面酶,位于细胞膜上,分解纤维素时,细菌必须附着在 纤维素表面。真菌和放线菌的纤维素酶为胞外酶,它们可以在胞外环境中起作用, 菌体无需直接与纤维素表面接触。 纤维素酶是多种作用于纤维素的酶的总称,它包括如下三种酶: ⑴ 、 C 1 酶(内 - β - 葡聚糖酶) 此酶主要水解纤维素分子内的β - 糖 苷键,产生带有自由末端的长链片段。一种微生物能分泌一种以上的 C 1 同功酶。 ⑵ 、 C X 酶(外 - β - 葡聚糖酶) 此酶作用于纤维素分子的末端,产生 纤维二糖。与 C 1 酶一样,一种微生物也能分泌出多种结构不同而功能相同的 C X 酶。 ⑶ 、纤维二糖酶 此酶能将纤维二糖水解成葡萄糖。 纤维酶对纤维素的水解过程可表示为:

能够分解纤维素的微生物很多。既有好氧性微生物,也有厌氧性微生物:既 有细菌,也有放线菌和真菌。放线菌的纤维素分解能力较弱,不及细菌和真菌。 许多真菌具有很强的纤维素分解能力。 3)几丁质的分解 几丁质是N-乙酰氨基葡萄糖以B-1,4键相连的大分子化合物,只有某些细 菌和放线菌能分解利用它,它们分泌几丁质酶,水解几丁质为N-乙酰葡萄糖胺。 几丁质是真菌细胞壁的组成成分,制原生质体时要用几丁质酶破壁。 4)果胶质的分解 果胶质是植物毗邻细胞之间的胞间层组分,占植物体干重的15%一30%。 果胶质由D-半乳糖醛酸通过α-1,4糖苷键连接的直链构成。链上的 羧基可部分或全部被甲醇酯化,也可部分或全部与阳离子结合。不含甲基酯的果 胶质称为果胶酸,含甲基酯的果胶质称果胶酯,后者可进一步与钙离子结合成不 溶于水的原果胶。 果胶质的分解需要一系列的酶的作用。(如图) 分解果胶质的微生物主要是细菌和真菌,且多数为植物病原菌。 5)半纤维素的分解 在植物体内,半纤维素的含量仅次于纤维素。半纤维素是由各种五碳糖、 六碳糖及糖醛酸组成的大分子聚合物。结构上可分为仅含一种单糖如木聚糖、半 乳聚糖、甘露聚糖等的同聚糖和有多种单糖或糖醛酸同时存在的异聚糖两类。但 实际上许多半纤维素的结构至今尚未探明。 分解半纤维素的微生物较多,分解速度也比纤维素快。细菌、放线菌和真菌 均有分解半纤维素的种。芽孢杆菌属的一些种能够分解甘露聚糖、半乳聚糖和木 聚糖,链孢霉属的一些种能够利用甘露聚糖、木聚糖;木霉、镰孢霉、曲霉、青 霉、交链孢霉等属的一些种可分解阿拉伯木聚糖和阿拉伯胶等。 半纤维素也不能直接透过细胞质膜,只有在胞外酶(聚糖酶)将其水解为单 糖以后,才能被进一步利用。一种微生物可以含有多种不同的半纤维素酶,因此 可以分解多种半纤维素。 第二节氮素循环(nitrogen cycle) 氮素是生物有机体的重要组成元素之一,是核酸和蛋白的主要成分

能够分解纤维素的微生物很多。既有好氧性微生物,也有厌氧性微生物;既 有细菌,也有放线菌和真菌。放线菌的纤维素分解能力较弱,不及细菌和真菌。 许多真菌具有很强的纤维素分解能力。 3) 几丁质的分解 几丁质是 N-乙酰氨基葡萄糖以β-1,4 键相连的大分子化合物,只有某些细 菌和放线菌能分解利用它,它们分泌几丁质酶,水解几丁质为 N-乙酰葡萄糖胺。 几丁质是真菌细胞壁的组成成分,制原生质体时要用几丁质酶破壁。 4) 果胶质的分解 果胶质是植物毗邻细胞之间的胞间层组分,占植物体干重的 15%-30% 。 果胶质由 D- 半乳糖醛酸通过α -1 , 4- 糖苷键连接的直链构成。链上的 羧基可部分或全部被甲醇酯化,也可部分或全部与阳离子结合。不含甲基酯的果 胶质称为果胶酸,含甲基酯的果胶质称果胶酯,后者可进一步与钙离子结合成不 溶于水的原果胶。 果胶质的分解需要一系列的酶的作用。(如图) 分解果胶质的微生物主要是细菌和真菌,且多数为植物病原菌。 5) 半纤维素的分解 在植物体内,半纤维素的含量仅次于纤维素。半纤维素是由各种五碳糖、 六碳糖及糖醛酸组成的大分子聚合物。结构上可分为仅含一种单糖如木聚糖、半 乳聚糖、甘露聚糖等的同聚糖和有多种单糖或糖醛酸同时存在的异聚糖两类。但 实际上许多半纤维素的结构至今尚未探明。 分解半纤维素的微生物较多,分解速度也比纤维素快。细菌、放线菌和真菌 均有分解半纤维素的种。芽孢杆菌属的一些种能够分解甘露聚糖、半乳聚糖和木 聚糖,链孢霉属的一些种能够利用甘露聚糖、木聚糖;木霉、镰孢霉、曲霉、青 霉、交链孢霉等属的一些种可分解阿拉伯木聚糖和阿拉伯胶等。 半纤维素也不能直接透过细胞质膜,只有在胞外酶(聚糖酶)将其水解为单 糖以后,才能被进一步利用。一种微生物可以含有多种不同的半纤维素酶,因此 可以分解多种半纤维素。 第二节氮素循环 (nitrogen cycle) 氮素是生物有机体的重要组成元素之一,是核酸和蛋白的主要成分

所以氮循环也是重要的物质循环。氮气在大气中所占比例约为79%,但 大多生物不能直接利用这种分子态的氮,只有通过某些原核微生物的固氮 作用转化为化合态氮一NH3:NH3可进一步被植物和微生物的同化作用转 化为有机氮:存于微生物和植物体内的有机氮又能为动物食用,最终以动 植物和微生物残体、分泌物、排泄物的有机氮形式,经微生物的氨化作用 释放出氨:氨在有氧条件经微生物的硝化作用氧化为硝酸和亚硝酸,在厌 氧条件下厌氧氧化为N2:硝酸和亚硝酸又可在无氧条件下经微生物的 反硝化作用,最终变成N2或N2O,返回至大气中,如此构成氮素生物 地球化学循环,见图。 可见,氮素循环是由微生物推动的,微生物是整个循环的核心,尤其是固氮 微生物 N循环比C循环复杂,包括有机氮和无机氨之间的转化和无机氮化物间的 相互转化。 (一)氨化作用 氨化作用(amonification):是指含氮有机物经微生物分解产生氨的过 程。这个过程又称为有机氮的对矿化作用(mineralization of organic nitrogen)。来自动物、植物、微生物的蛋白质、氨基酸、尿素、几丁质、 以及核酸中的嘌吟和嘧啶等含氮有机物,均可通过氨化作用而释放氨,供植 物和微生物利用。同时也释放到大气中,这个部分占总氮损失的5%(其它 主要为反硝化所损失)。 1.蛋白质的氨化 蛋白质不能直接透过细胞膜而进入微生物体内。蛋白质的分解通常分为二个 阶段:首先,在微生物所分泌的蛋白酶作用下,蛋白质水解成各种氨基酸:然后, 在体内脱氨酶的作用下氨基酸被分解释放出氨。 脱氨作用有几种方式:水解脱氨、脱水脱氨、氧化脱氨、还原脱氨、氧化还 原脱氨。(氨基酸的分解还有脱羧作用) 蛋白质氨化微生物:能够分解蛋白质的微生物很多,但分解速度各不相同。 分解蛋白质能力强并释放出氨的微生物称为氨化微生物。氨化细菌可以下列各菌 为代表:

所以氮循环也是重要的物质循环。氮气在大气中所占比例约为 79%,但 大多生物不能直接利用这种分子态的氮,只有通过某些原核微生物的固氮 作用转化为化合态氮—NH3;NH3 可进一步被植物和微生物的同化作用转 化为有机氮;存于微生物和植物体内的有机氮又能为动物食用,最终以动 植物和微生物残体、分泌物、排泄物的有机氮形式,经微生物的氨化作用 释放出氨;氨在有氧条件经微生物的硝化作用氧化为硝酸和亚硝酸,在厌 氧条件下厌氧氧化为 N 2 ;硝酸和亚硝酸又可在无氧条件下经微生物的 反硝化作用,最终变成 N 2 或 N 2O,返回至大气中,如此构成氮素生物 地球化学循环,见图。 可见,氮素循环是由微生物推动的,微生物是整个循环的核心,尤其是固氮 微生物。 N 循环比 C 循环复杂,包括有机氮和无机氮之间的转化和无机氮化物间的 相互转化。 (一) 氨化作用 氨化作用( amonification ):是指含氮有机物经微生物分解产生氨的过 程。这个过程又称为有机氮的矿化作用 (mineralization of organic nitrogen) 。 来自动物、植物、微生物的蛋白质、氨基酸、尿素、几丁质、 以及核酸中的嘌呤和嘧啶等含氮有机物,均可通过氨化作用而释放氨,供植 物和微生物利用。同时也释放到大气中,这个部分占总氮损失的 5%(其它 主要为反硝化所损失)。 1. 蛋白质的氨化 蛋白质不能直接透过细胞膜而进入微生物体内。蛋白质的分解通常分为二个 阶段:首先,在微生物所分泌的蛋白酶作用下,蛋白质水解成各种氨基酸;然后, 在体内脱氨酶的作用下氨基酸被分解释放出氨。 脱氨作用有几种方式:水解脱氨、脱水脱氨、氧化脱氨、还原脱氨、氧化还 原脱氨。(氨基酸的分解还有脱羧作用) 蛋白质氨化微生物:能够分解蛋白质的微生物很多,但分解速度各不相同。 分解蛋白质能力强并释放出氨的微生物称为氨化微生物。氨化细菌可以下列各菌 为代表:

(1)兼性厌氧的无芽孢杆菌 荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens),粘质赛氏杆菌(Serratia marcescens)和普通变形杆菌(Proteus vulgaris)是不生芽孢的革兰氏阴性杆 菌,兼性厌氧,在有氧和无氧条件下都能进行强烈的氨化作用。 (2)好氧性芽孢杆菌 能够进行氨化作用的好氧芽孢杆菌有巨大芽孢杆菌(Baci训us megaterium),蜡质芽孢杆菌霉状变种和枯草芽孢杆菌。 (3)厌氧芽孢杆菌 腐败梭菌(Clostridium putrificum)是一种分解蛋白质能力很强的厌氧细 菌,芽孢端生、膨大,菌体呈鼓槌状,分解蛋白质时产生恶臭。能够进行Stickland 反应脱氨的细菌均是专性厌氧的梭状芽孢杆菌,但并不是所有的梭状芽孢杆菌都 能进行Stickland反应 (4)真菌 在蛋白质的分解中也占有重要地位。交链胞霉属(Alternaria)、曲霉属 (Aspergillus)、毛霉属(Mucor)、青霉属(Penicillium)、根霉属(Rhizopus) 及木霉属(Trichoderma)等属的真菌研究得较为深入。真菌在某些土壤特别是 酸性土壤的蛋白质分解中起着主要作用。 (5)放线菌 大量的放线菌也分泌胞外蛋白酶,从土壤中分离到的放线菌有15% ~17%能产蛋白酶。嗜热性放线菌在堆肥高温阶段的蛋白质分解中是十分活跃的 类群。 2核酸的氨化作用 核酸是动、植物及微生物尸体的主要成分之一,可以被微生物所分解。核酸 分解时,先由胞外核糖核酸酶或胞外脱氧核糖核酸酶将大分子降解,形成单核苷 酸。单核苷酸脱磷酸成为核苷,然后将嘌吟或嘧啶与糖分开。嘌吟和嘧啶可被多 种微生物,如诺卡氏菌(Nocardia)、假单胞菌、小球菌(Micrococcus)和梭 状芽孢杆茵等,进一步分解,形成含氮产物氨基酸、尿素及氨。 3尿素的氨化作用

( 1 )兼性厌氧的无芽孢杆菌 荧光假单胞菌 ( Pseudomonas fluorescens ) ,粘质赛氏杆菌 ( Serratia marcescens ) 和普通变形杆菌 (Proteus vulgaris ) 是不生芽孢的革兰氏阴性杆 菌,兼性厌氧,在有氧和无氧条件下都能进行强烈的氨化作用。 ( 2 )好氧性芽孢杆菌 能够进行氨化作用的好氧芽孢杆菌有巨大芽孢杆菌 ( Bacillus megaterium ) ,蜡质芽孢杆菌霉状变种和枯草芽孢杆菌。 ( 3 )厌氧芽孢杆菌 腐败梭菌 ( Clostridium putrificum ) 是一种分解蛋白质能力很强的厌氧细 菌,芽孢端生、膨大,菌体呈鼓槌状,分解蛋白质时产生恶臭。能够进行 Stickland 反应脱氨的细菌均是专性厌氧的梭状芽孢杆菌,但并不是所有的梭状芽孢杆菌都 能进行 Stickland 反应。 (4)真菌 在蛋白质的分解中也占有重要地位。交链胞霉属 ( Alternaria ) 、曲霉属 ( Aspergillus ) 、毛霉属 ( Mucor ) 、青霉属 ( Penicillium ) 、根霉属 ( Rhizopus ) 及木霉属 ( Trichoderma ) 等属的真菌研究得较为深入。真菌在某些土壤特别是 酸性土壤的蛋白质分解中起着主要作用。 (5)放线菌 大量的放线菌也分泌胞外蛋白酶,从土壤中分离到的放线菌有 15 % ~17% 能产蛋白酶。嗜热性放线菌在堆肥高温阶段的蛋白质分解中是十分活跃的 类群。 2 核酸的氨化作用 核酸是动、植物及微生物尸体的主要成分之一,可以被微生物所分解。核酸 分解时,先由胞外核糖核酸酶或胞外脱氧核糖核酸酶将大分子降解,形成单核苷 酸。单核苷酸脱磷酸成为核苷,然后将嘌呤或嘧啶与糖分开。嘌呤和嘧啶可被多 种微生物,如诺卡氏菌 ( Nocardia ) 、假单胞菌、小球菌 ( Micrococcus ) 和梭 状芽孢杆菌等,进一步分解,形成含氮产物氨基酸、尿素及氨。 3 尿素的氨化作用

尿素是人和动物排泄物中的主要含氮有机物。每个成年人一昼夜排出尿素约 30g,全年计约11kg,动物排出的尿素则更多。地球上人和动物每年所排出 的尿达数千万吨。此外,尿素是化学肥料的一个重要品种,也是核酸分解的产物。 在适宜的温度下,尿素可被迅速分解。 分解尿素的微生物广泛分布在土壤和污水池中,特别在粪尿池及堆粪场上。 大多数细菌、放线菌、真菌都有尿酶,能分解尿素产生氨。 常见的分解尿素的微生物有:芽孢杆菌、小球菌、假单胞菌、克氏杆菌 (Klebsiella)、棒状杆菌(Corynebacterium)、梭状芽孢杆菌。某些真菌和放 线菌也能分解尿素。有一小群细菌特别被称为尿素细菌,它们不但能够耐高浓度 尿素,而且还能够耐高浓度尿素水解时产生的强碱性。如巴斯德尿素芽孢杆菌 (Urobacilluspasteurii),在1L溶液中培养时,能分解140g尿素, 土壤施用尿素肥料时,尿素颗粒附近的pH值可超过8.0,有时达9.0。 在此碱性条件下,产生的氨气极易挥发损失。因此,施肥时,往往要用土覆盖, 不与碱性物混合使用,防止氨的损失。 环境对氨化作用的影响: >水分:潮湿、通气好的土壤氨化作用快: >温度:有机氮矿化作用随温度上升而加快: >p州值:中性土壤有机氮的矿化速度高于酸性土壤,但碱性土中, 随pH升高,氨的挥发损失越大。 >CN:矿化作用和固定作用的相对强弱与有机物质的碳氮比例 密切相关。微生物对各个营养成分的要求有一定比例: CN小时,碳素少,微生物的氮素固定作用就小于矿化作用, 多余的部分氮素即可释放积累于环境中,供植物利用。 CN大时,氨素少,则微生物的氮素固定作用不仅用尽矿化作 用所释放的无机态氮,而且还要从周围环境中吸收无机态氮以弥补 不足。微生物与植物争夺无机氮,影响植物的生长发育:CN30时,微生物从 环境中吸收无机氮(NH4+和NO3)。 (二)硝化作用

尿素是人和动物排泄物中的主要含氮有机物。每个成年人一昼夜排出尿素约 30g ,全年计约 11kg ,动物排出的尿素则更多。地球上人和动物每年所排出 的尿达数千万吨。此外,尿素是化学肥料的一个重要品种,也是核酸分解的产物。 在适宜的温度下,尿素可被迅速分解。 分解尿素的微生物广泛分布在土壤和污水池中,特别在粪尿池及堆粪场上。 大多数细菌、放线菌、真菌都有尿酶,能分解尿素产生氨。 常见的分解尿素的微生物有:芽孢杆菌、小球菌、假单胞菌、克氏杆菌 ( Klebsiella ) 、棒状杆菌 ( Corynebacterium ) 、梭状芽孢杆菌。某些真菌和放 线菌也能分解尿素。有一小群细菌特别被称为尿素细菌,它们不但能够耐高浓度 尿素,而且还能够耐高浓度尿素水解时产生的强碱性。如巴斯德尿素芽孢杆菌 ( Urobacillus pasteurii ) ,在 1L 溶液中培养时,能分解 140g 尿素。 土壤施用尿素肥料时,尿素颗粒附近的 pH 值可超过 8.0 ,有时达 9.0 。 在此碱性条件下,产生的氨气极易挥发损失。因此,施肥时,往往要用土覆盖, 不与碱性物混合使用,防止氨的损失。 环境对氨化作用的影响: ➢ 水分:潮湿、通气好的土壤氨化作用快; ➢ 温度:有机氮矿化作用随温度上升而加快; ➢ pH 值:中性土壤有机氮的矿化速度高于酸性土壤,但碱性土中, 随 pH 升高,氨的挥发损失越大。 ➢ C/N: 矿化作用和固定作用的相对强弱与有机物质的碳氮比例 密切相关。微生物对各个营养成分的要求有一定比例。 C/N 小时,碳素少,微生物的氮素固定作用就小于矿化作用, 多余的部分氮素即可释放积累于环境中,供植物利用。 C/N 大时,氮素少,则微生物的氮素固定作用不仅用尽矿化作 用所释放的无机态氮,而且还要从周围环境中吸收无机态氮以弥补 不足。微生物与植物争夺无机氮,影响植物的生长发育;C/N30 时,微生物从 环境中吸收无机氮(NH4 +和 NO3 -)。 (二) 硝化作用

硝化作用(nitrification):微生物在好氧条件下,将氨氧化成硝酸,并从中 获取生活所需能量的过程。硝化作用分为二个阶段:第一阶段为氨氧化成亚 硝酸:第二个阶段为亚硝酸氧化成硝酸。是一个产能的过程。 相应地,也将铵氧化为亚硝酸的细菌称为亚硝酸细菌,或铵氧化菌 (ammonia oxidizer0):将亚硝酸氧化为硝酸的细菌称为硝酸细菌,或亚硝酸 氧化菌(nitrite oxidizer)。两者统称为硝化细菌。 亚硝酸细菌:亚硝酸单胞菌、亚硝酸螺菌、亚硝酸球菌、亚硝酸叶菌4 个属。最早分离的亚硝酸细菌为亚硝酸单胞菌(Nitrosomonas),是土壤 中普遍存在的铵氧化菌。 硝酸细菌:硝酸杆菌、硝酸刺菌、硝酸球菌 上述菌是严格的化能自养菌。有些异养菌也可进行硝化作用,但能力不 如硝化细菌。 硝化作用产生的硝酸盐,在有氧条件下,可被植物、微生物同化:在缺 氧条件下,则被还原为分子态氮一一反硝化作用。 硝化作用与士裹肥力及环境污染 >硝化作用的最适pH值为6.6~8.0,温度界限在4-40℃之间,最适 温度为25一35°C,通气良好有利于硝化作用(因硝化作用严格好 氧)。土壤中含有丰富的蛋白质有机物进入时,硝化作用会加剧进 行。 >硝化作用可促进难溶化合物的溶解,NOg易被植物吸收同化。 >但NOg在土壤中的流动性大,也可以造成流失:NO过多还会造 成水域的污染。 若硝酸盐进入地下水或流入水井,则会导致饮用水中硝酸盐浓度升高。人畜饮用 污染水后,硝酸将在肠肖里还原成亚硝酸。后者进入血液并与其中的血红蛋白作用而 形成氧化态血红蛋白,损害机体内氧的运输,使人类患氧化血红蛋白病,呼吸困难。3 个月以下的竖儿对硝酸的毒害极为敏感。反刍动物也可因饮入过量硝酸盐而死亡。 硝酸盐流入水体,使水体营养成分增加,导致浮游生物和藻类旺盛生长,这种现 象称作富营养化(eutrophication)。硝化过程也产生相当数量N2O,是一种温室效应 气体,可导致臭氧层的破坏

硝化作用 (nitrification):微生物在好氧条件下,将氨氧化成硝酸,并从中 获取生活所需能量的过程。硝化作用分为二个阶段:第一阶段为氨氧化成亚 硝酸;第二个阶段为亚硝酸氧化成硝酸。是一个产能的过程。 相应地,也将铵氧化为亚硝酸的细菌称为亚硝酸细菌,或铵氧化菌 (ammonia oxidizer) ;将亚硝酸氧化为硝酸的细菌称为硝酸细菌,或亚硝酸 氧化菌 (nitrite oxidizer) 。两者统称为硝化细菌。 亚硝酸细菌:亚硝酸单胞菌、亚硝酸螺菌、亚硝酸球菌、亚硝酸叶菌 4 个属。最早分离的亚硝酸细菌为亚硝酸单胞菌 ( Nitrosomonas ) ,是土壤 中普遍存在的铵氧化菌。 硝酸细菌:硝酸杆菌、硝酸刺菌、硝酸球菌 上述菌是严格的化能自养菌。有些异养菌也可进行硝化作用,但能力不 如硝化细菌。 硝化作用产生的硝酸盐,在有氧条件下,可被植物、微生物同化;在缺 氧条件下,则被还原为分子态氮——反硝化作用。 硝化作用与土壤肥力及环境污染 ➢ 硝化作用的最适 pH 值为 6.6~8.0,温度界限在 4-40℃之间,最适 温度为 25~35ºC,通气良好有利于硝化作用(因硝化作用严格好 氧)。土壤中含有丰富的蛋白质有机物进入时,硝化作用会加剧进 行。 ➢ 硝化作用可促进难溶化合物的溶解,NO3 -易被植物吸收同化。 ➢ 但 NO3 -在土壤中的流动性大,也可以造成流失;NO3 -过多还会造 成水域的污染。 若硝酸盐进入地下水或流入水井,则会导致饮用水中硝酸盐浓度升高。人畜饮用 污染水后,硝酸将在肠胃里还原成亚硝酸。后者进入血液并与其中的血红蛋白作用而 形成氧化态血红蛋白,损害机体内氧的运输,使人类患氧化血红蛋白病,呼吸困难。3 个月以下的婴儿对硝酸的毒害极为敏感。反刍动物也可因饮入过量硝酸盐而死亡。 硝酸盐流入水体,使水体营养成分增加,导致浮游生物和藻类旺盛生长,这种现 象称作富营养化 (eutrophication)。硝化过程也产生相当数量 N 2 O ,是一种温室效应 气体,可导致臭氧层的破坏

(三)反硝化作用 铵盐和硝酸盐除能被植物和微生物吸收和同化利用外,还能被反硝化细 菌利用。 微生物在无氧条件下,以硝酸盐作为呼吸链的末端电子受体,将之还原 为亚硝酸盐,并进一步还原为NO、N0乃至的过程,称为反硝化作用,又 称脱氯作用。 NO; ◆NO2 NON20N2 参与反硝化作用的微生物: 具有反硝化作用的微生物在自然界普遍存在。Ingraham(1981)指出有 71属菌能进行反硝化作用,它们在土壤中很丰言,占细菌群落的40% 65%,细菌数高达108个/g土。到目前为止,尚未发现细菌以外的其它 生命形式能够进行反硝化作用。 反硝化细菌:是兼性厌氧菌,主要有假单胞菌属、产碱杆菌属、芽孢杆 菌属、硫杆菌属、副球菌属、奈氏球菌属等。 反硝化作用的不利影响: 反硝化作用引起土壤氮素损失,是氮素化肥利用率不高的一个重要原 因:从全球估计,反硝化作用所损失的氮大约相当于生物和工业所固定的氨 量。施用反硝化抑制剂可收到良好的效果。 反硝化作用的中间产物对植物根部有毒害作用。 其产物N0和NO破坏O层。 防治措施: 合理换水,使土壤通气良好:在水田里避免使用硝态氮:施肥后即 耘田:使用氮肥增效剂(反硝化作用抑制剂)。 反硝化作用虽有上述不利影响,但从自然界氮素循环角度看,它又是 不可缺少的一种有益作用,如该作用停止,大气中氮气减少和组成分的改 变,势必影响生物的生存

(三) 反硝化作用 铵盐和硝酸盐除能被植物和微生物吸收和同化利用外,还能被反硝化细 菌利用。 微生物在无氧条件下,以硝酸盐作为呼吸链的末端电子受体,将之还原 为亚硝酸盐,并进一步还原为 NO、N2O 乃至 N2的过程,称为反硝化作用,又 称脱氮作用。 参与反硝化作用的微生物: 具有反硝化作用的微生物在自然界普遍存在。Ingraham(1981) 指出有 71 属菌能进行反硝化作用,它们在土壤中很丰富,占细菌群落的 40 % - 65% ,细菌数高达 10 8 个 /g 土。到目前为止,尚未发现细菌以外的其它 生命形式能够进行反硝化作用。 反硝化细菌:是兼性厌氧菌,主要有假单胞菌属、产碱杆菌属、芽孢杆 菌属、硫杆菌属、副球菌属、奈氏球菌属 等。 反硝化作用的不利影响: 反硝化作用引起土壤氮素损失,是氮素化肥利用率不高的一个重要原 因;从全球估计,反硝化作用所损失的氮大约相当于生物和工业所固定的氮 量。施用反硝化抑制剂可收到良好的效果。 反硝化作用的中间产物对植物根部有毒害作用。 其产物 N2O 和 NO 破坏 O3层。 防治措施: 合理换水,使土壤通气良好;在水田里避免使用硝态氮;施肥后即 耘田;使用氮肥增效剂(反硝化作用抑制剂)。 反硝化作用虽有上述不利影响,但从自然界氮素循环角度看,它又是 不可缺少的一种有益作用,如该作用停止,大气中氮气减少和组成分的改 变,势必影响生物的生存

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