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《普通遗传学实验》课程教学课件(讲稿)遗传作图和QTL分析

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《普通遗传学实验》课程教学课件(讲稿)遗传作图和QTL分析
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实验八遗传作图和QTL分析

实验八 遗传作图和QTL分析

一、实验目的·学习遗传作图的原理及方法·学习QTL分析的原理和基本步骤,掌握QTLIciMapping软件的使用方法

一、实验目的 l 学习遗传作图的原理及方法, l 学习QTL分析的原理和基本步骤, l 掌握QTL IciMapping软件的使用方法

1二、实验原理1.遗传作图:确定相互连锁基因在染色体上的相对位置以及它们之间的遗传距离的过程,又称基因定位(genemapping)。P2:aabbP1:AABB护肿X?F1:AaBbB6Meiosis肉中

二、实验原理 1.遗传作图:确定相互连锁基因在染色体上的相对位置以及 它们之间的遗传距离的过程,又称基因定位(gene mapping)

A三点测验玉米第9染色体上三对基因间连锁分析:遗传作图子粒颜色:有色(C)对无色(c)为显性:饱满程度:饱满(Sh)对凹陷(sh)为显性;淀粉粒:非糯性(Wx)对糯性(wx)为显性21.918.43.5Cwxsh

三点测验 遗传作图 玉米第9染色体上三对基因间连锁分析: 子粒颜色:有色(C)对无色(c)为显性; 饱满程度:饱满(Sh)对凹陷(sh)为显性; 淀粉粒: 非糯性(Wx)对糯性(wx)为显性

Ch二12150-1-Green-baseUniformfruitNormal(L)23Fasciated()Red (R)Nomal(M)Mottled(m)EYellow ()(U)(u)水水中19VPurole (A)Green (a)18Smooth (H)Hairy (h)Tall(D)Dwart(d)Yellow(W)White(w)267Hairy (HI)Hairless (h)2733nNon-tangerineTangerine ()Sncoth(P)Peach(p))Normal(L)30Leafy (if)56-Normal(O)Oblate(o)Normal(Br)Brachytic (br)XanthophyllousGreen (xa)?64(Xa/xa)Jointed (J)Jointless()8WoollyNormal(wo)Resistanceto(wawo)35SusceptibilityYelowskin(M)Clear skin(y)leafmoldfrom81toleafmoldPotentate#285ResistanceSusceptibilityto(cfp2)小(Cfp2)小86toleafmoldleafmoldfromNormal(Ne)Necrotic(ne)(Cfsc)SterlingCastlePurplestem爱Anthocyanin(cfsc)(A)1042loser4Wilty (w)Nonwilty (w)(al)106-9SmpleCompound108~inflor.(S)infior.(s)金121CompactSpreadNonwilty(Nt)Nipple-tip(nt)127Cutleaf(c)Potatoleaf(c)dwarf modifierdwarf129Beaked(Bk)Beaked(bk)6(Dm)(dm)133-10135-1401m145Indeterm-MarryMarrySelfpruring(sp)BroadNarrowGreen (L)Lutescent()inate (Sp)looules(Lc)looules(lc)27cotyledonscotyledons154158(Nc)(nc)SusceptibilitytoResistance11161leafmoldfromto leafmoldAOPotentate#1(Cfp1)(cfp1)Normal(Bu)Bushy(bu)Normal (B)Broad (b)12番茄的连锁遗传图Nomal(Mc)Macrocalyx

三2.分子标记:DNA水平上的标记P2P2P1P112电林方向DNAB82防切电坊BI82B2一杂交F14241FB2B1++82自交!P1P2RIR2PiP2R2RIR1PIP2R1PL:P22F2823282.81S

2.分子标记:DNA水平上的标记 P1 P2

EAAXNpt212-2##沙业店XNES-2735339333839140C112XoCOis318lspaE58021VTY-C393844XONpE54XNe016462P6.3R3208分子遗传图谱C3SSAG25010.4-TSTXNE23277159C36CED1GDS3342XNeESEXetog85.D16.3U7C145896C3389CSC55640.81C2340C1351C22Ca133289XNbe16.67255e3CSD82二XDCE739[2]LC121R19C137062-1189.6CTI6A142G1316901R10123tC805.840t32XNEe7一261284.68R2083CT可用于:48121R366R1988C14935##5#a964RMCheLKEC14548一tAT江话3513323,OTSSSRSTSR3196XNpE5T-2xNecm0基因定位R1458C10.7 EOC13219202394XNe230堂RAEDQTL分析55eC29D83xpeaseXN0349XNe0184营12.392HRS18VB3BCHES标记辅助选择110143116Xg2792三48#S2基因图位克隆R161315xe216C97D

分子遗传图谱 可用于: 基因定位 QTL分析 标记辅助选择 基因图位克隆

3.数量性状:群体中表现连续性变异的性状wild.riceisialctispeltwheatonlin+wheatP1DHSDHLP2

3.数量性状:群体中表现连续性变异的性状

数量性状的遗传基础:受微效多基因控制:受主效基因和微效基因共同控制借助于分子标记和数量性状基因位点(quantitativetraitloci.QTL)分析,可在分子标记连锁图上标出单个基因位点的位置,确定其基因效应

数量性状的遗传基础: 受微效多基因控制;受主效基因和微效基因共同控制 借助于分子标记和数量性状基因位点(quantitative trait loci, QTL)分析,可在分子标记连锁图上标出单个基因位点的位置、 确定其基因效应

数量遗传基因定位(QTL分析)的目的:·控制数量性状的基因有多少?在什么地方?表型效应有多大?和其它基因间有无互作?和环境间有无互作?

数量遗传基因定位(QTL分析)的目的:

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