复旦大学:《细胞与医学遗传学实验》教学课件_遗传病的分析——基因组DNA提取与PCR扩增技术
遗传病的分析4 基因组DNA提取与PCR扩增技术
遗传病的分析4 基因组DNA提取与PCR扩增技术
、基因组DNA提取
一、基因组DNA提取
实验目的 基因组DNA的制备是基因分析的前提。 ·本实验要求掌握基因组DNA提取的基本方 法
实验目的 • 基因组DNA的制备是基因分析的前提。 • 本实验要求掌握基因组DNA提取的基本方 法
原理 DNA在生物体内是与蛋白质形成复合物的形 式存在的。核酸与蛋白质之间的结合力包括离子 键、氢键、范德华力等,破坏或降低这些结合力 就可把核酸与蛋白分开 DNA、RNA所含有的嘌呤环和嘧啶环的共轭 双键具有吸收紫外光的性质,吸收高峰在260nm 处,所以,可用紫外分光光度法测定DNA的浓度
原 理 DNA在生物体内是与蛋白质形成复合物的形 式存在的。核酸与蛋白质之间的结合力包括离子 键、氢键、范德华力等,破坏或降低这些结合力 就可把核酸与蛋白分开。 DNA、RNA所含有的嘌呤环和嘧啶环的共轭 双键具有吸收紫外光的性质,吸收高峰在260nm 处,所以,可用紫外分光光度法测定DNA的浓度
原理 基因组DNA提取试剂盒:在高盐的状 态下,DNA纯化树脂专一性地吸附DNA 而在低盐或水溶液状态下,DNA被洗脱下 来
原理 基因组DNA提取试剂盒:在高盐的状 态下,DNA纯化树脂专一性地吸附DNA; 而在低盐或水溶液状态下,DNA被洗脱下 来
器材与试剂 台式高速离心机、天平、水浴恒温箱、移 液枪、塑料离心管等 ·试剂盒(纯化树脂、GN结合液、漂洗液、 无水乙醇、离心纯化柱)、TE缓冲液
器材与试剂 • 台式高速离心机、天平、水浴恒温箱、移 液枪、塑料离心管等 • 试剂盒(纯化树脂、GN结合液、漂洗液、 无水乙醇、离心纯化柱 )、TE缓冲液
操作 1、将全血轻轻混匀,转移0.5m全血到1m纯化树脂中, 颠倒混匀5-6次,室温,3min。其间要颠倒混匀1次, 5000/min离心×3sec; 2、取沉淀,加1mGN结合液悬浮沉淀,颠倒混匀, 5000/mn离心×3seC; 3、取沉淀,加0.5m漂洗液纯化树脂2次,颠倒混匀, 5000/min离心×3eCs; 4、取沉淀,加0.8m无水乙醇悬浮沉淀,颠倒混匀 装入离心纯化柱,12000/min离心×1min,弃乙醇 液; 5、空柱再12000r/min离心×1min,进一步弃乙醇液; 6、取离心好的纯化柱套入一干净的1.5m离心管中,加 入100uT缓冲液于纯化树脂上(不能粘在管壁上), 室温下放置3min,12000r/mn离心×2min
操作 1、将全血轻轻混匀,转移0.5ml全血到1ml纯化树脂中, 颠倒混匀5-6次,室温,3min。其间要颠倒混匀1次, 5000r/min离心×3sec; 2、取沉淀,加1mlGN结合液悬浮沉淀,颠倒混匀, 5000r/min离心×3sec; 3、取沉淀,加0.5ml漂洗液纯化树脂2次,颠倒混匀, 5000r/min离心×3ecs; 4、取沉淀, 加0.8ml无水乙醇悬浮沉淀,颠倒混匀; 装入离心纯化柱,12000r/min离心×1min,弃乙醇 液; 5、空柱再12000r/min离心×1min,进一步弃乙醇液; 6、取离心好的纯化柱套入一干净的1.5ml离心管中,加 入100ul TE缓冲液于纯化树脂上(不能粘在管壁上), 室温下放置3min,12000r/min离心×2min
注意事项 般情况下,纯净的 DNA OD260/○D280比值 约为1.8,RNA为20。若样品中含蛋白质,则比 值下降,必要时需重新抽提。若DNA的比值 <175,则加入SDS至0.5%; 从核酸中去除蛋白质时,常用到酚:氯仿等体 积混合液。氯仿的作用是使蛋白质变性并有助 于水相和有机相的分离; DNA用TE溶解,可增加DNA的稳定性,便于长 期保存
注意事项 • 一般情况下,纯净的DNA OD260/OD280比值 约为1.8,RNA为2.0。若样品中含蛋白质,则比 值下降,必要时需重新抽提。若DNA的比值 <1.75,则加入SDS至0.5%; • 从核酸中去除蛋白质时,常用到酚:氯仿等体 积混合液。氯仿的作用是使蛋白质变性并有助 于水相和有机相的分离; • DNA用TE溶解,可增加DNA的稳定性,便于长 期保存
二、PCR扩增技术
二、PCR扩增技术
实验原理 多聚酶链反应(PCR)技术的原理类似于 DNA的天然复制过程。可简述为: 在微量离心管中加入适量缓冲液,加入微 量模板DNA,四种脱氧核苷酸(dNTP), 和耐热Taq聚合酶及两个合成的DNA引物, 并有Mg2+存在
实验原理 • 多聚酶链反应(PCR)技术的原理类似于 DNA的天然复制过程。可简述为: • 在微量离心管中加入适量缓冲液,加入微 量模板DNA,四种脱氧核苷酸(dNTP), 和耐热Taq聚合酶及两个合成的DNA引物, 并有Mg2+存在
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