浙江大学：中国糯玉米蜡质基因位点受到人工选择的分子证据 Molecular evidence for domestication selection in the waxy locus of Chinese waxy maize

洲江導 ZheJiang University 中国糯玉米蜡质基因位点受 到人工选择的分子证据 Molecular evidence for domestication selection in the waxy locus of Chinese waxy maize 导师:樊龙江教授 报告人:全丽艳

中国糯玉米蜡质基因位点受 到人工选择的分子证据 导 师：樊龙江教授 报告人：全丽艳 Molecular evidence for domestication selection in the waxy locus of Chinese waxy maize

ZheJiang University 第一部分文献综述 糯玉米的由来 濡玉米研究现状 糯玉米的生物特性 国内外对糯玉米的研究进展 蜡质基因研究现状)蜡质基因的基本信息 蜡质基因研究的国内外现状 蜡质基因位点的人工选择作用 人工选择对 基因的影响 选择的连带效应 Adh基因家族研究情况

第一部分 文献综述 糯玉米的由来 糯玉米的生物特性 国内外对糯玉米的研究进展 蜡质基因的基本信息 蜡质基因研究的国内外现状 蜡质基因位点的人工选择作用 选择的连带效应 Adh基因家族研究情况 糯玉米研究现状 蜡质基因研究现状 人工选择对 基因的影响

少 ZheJiang Universi 第二部分研究报告 材料与方法 结果与分析 讨论

第二部分 研究报告 • 材料与方法 • 结果与分析 • 讨论

ZheJiang University 材料与方法 材料 DNA提取与测序 序列分析方法

材料与方法 • 材料 • DNA提取与测序 • 序列分析方法

编号原序号品种名称 类型 产地基因位点 材料 据库编号 来源 向3方向Adh1 wox+la1 C129 四路糯 地方品种云南√ c226 宜山糯 地方品种广西小 巧家白糯 地方品种云南「√ C428 慈溪白糯 地方品种「浙江「小 622016-ZCN 自交系 622023W2982自交系 622033-CN-33 自交系 自交系 10 622078cN-78 自交系 C1012 6220CN106自交系 c1I1362140N142自交系 c121462147N148自交系 C1315 6217CN159自交系 C1416 62221CN-203自交系 C1517622244CN-46 自交系 c161862219c021自交系 C1719 N23-16-2-2-1 自交系 C1820 N1116-1-1-1-1自交系 C1921 N26-1-1-22 自交系 44444444333333 C2023 N2243-2-1 自交系 c2124 CN9.5-1 自交系 √√√√ √√√ √√√√√ C2225 N326-33 自交系 MeAl 自交系 小计 11 9 C24 苏玉糯1号 杂交种 表1本研究使用的 科糯986 杂交种 √√√√ 3 C26 浙风2号 杂交种 中国糯玉米材料 燕禾金2000 杂交种 来源和基因序列 合计 261l 记录号 惹苡 野生种浙江小 自备 Coix lacryma-jobi

表1 本研究使用的 中国糯玉米材料、 来源和基因序列 记录号

ZheJiang University 图1中国糯玉米典型地方品种四路糯

图1 中国糯玉米典型地方品种四路糯

ZheJiang University 11E.F 3UTR 1E-F 3E-R P-F P-RI 891011121314 SUT-F2 2E-R2 3EF SE-R WX-F WX-R P-F1 P-R 图2玉米蜡质基因结构和本研究引物设计位点

图2 玉米蜡质基因结构和本研究引物设计位点

设计引物 提取糯玉米DNA自 PCR扩增 纯化回收PCR产物 MD18/19 T Vector纯化后的PCR产物补A E coli. DH5a感受态细胞 连接 化 挑选阳性克隆 阳性克隆的筛选与鉴定 DNA提取 与测序技 测序 术路线 序列分析

DNA提取 与测序技 术路线

ZheJiang University 核苷酸差异平均值π Watterson估计 序列多态性分析 参数θw Taj imal的D统计量 进行统计测验 序列分析方法W单体型树 (haplotype 系统发育树 MEGA进行临接法 (NJ Kimura phylogenetic tree 双参数建树

序列分析方法 序列多态性分析 Wx 单体型树 （haplotype） 系统发育树 （phylogenetic tree） 核苷酸差异平均值π Watterson估计 参数θw Tajima的D统计量 进行统计测验 MEGA进行临接法 （NJ）Kimura 双参数建树

ZheJiang University 结果与分析 中国糯玉米的表观直链淀粉含量 中国糯玉米蜡质基因位点的遗传变异 中国糯玉米蜡质基因位点的选择和选择 连带效应 中国糯玉米的系统进化分析

结果与分析 • 中国糯玉米的表观直链淀粉含量 • 中国糯玉米蜡质基因位点的遗传变异 • 中国糯玉米蜡质基因位点的选择和选择 连带效应 • 中国糯玉米的系统进化分析