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《分子生物学》课程教学课件(PPT讲稿)第二章 染色体与DNA(3/3)

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《分子生物学》课程教学课件(PPT讲稿)第二章 染色体与DNA(3/3)
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DNA的变性与复性

DNA的变性与复性

本节学习重点 ·DNA变性曲线,包括增色效应、减色效应 、Tm及其影响因素 ·DNA复性曲线,包括影响复性的诸多因素 和Cot2

本节学习重点 • DNA变性曲线,包括增色效应、减色效应 、 Tm及其影响因素 • DNA复性曲线,包括影响复性的诸多因素 和 C0 t(1/2)

一、DNA分子的变性 l、变性(denaturation或融解melting): DNA双螺旋区的氢键断裂,使双螺旋的两条链完全分开 变成单链,这一链分离的过程叫做变性。 条件:加热,高pH,有机溶剂(尿素、酰胺),低盐浓度等

一、DNA分子的变性 1、变性(denaturation 或 融解 melting): DNA双螺旋区的氢键断裂,使双螺旋的两条链完全分开 变成单链,这一链分离的过程叫做变性。 条件:加热,高pH,有机溶剂(尿素、 酰胺 ),低盐浓度等

※熔液黏度降低 ※沉降速度加大 ※浮力密度上升 ※此外吸收值升高(A260nm),即增色效应 指在DNA变性的过程中,它在260nm的吸收值先是缓慢 上升,达到某一温度时及骤然上升。 单一核苷酸的光吸收值最大,其实是单链DNA或RNA,双 链DNA最小,这是由于碱基在疏水环境中的堆积所造成的。 即双链DNA相对于单链DNA是减色的(hypochromic),反 之单链DNA相对于双链DNA是增色的(hyperchromic)

※ 熔液黏度降低 ※ 沉降速度加大 ※ 浮力密度上升 ※ 此外吸收值升高(A260nm),即增色效应 指在DNA变性的过程中,它在260nm的吸收值先是缓慢 上升,达到某一温度时及骤然上升。 单一核苷酸的光吸收值最大,其实是单链DNA 或RNA,双 链DNA最小,这是由于碱基在疏水环境中的堆积所造成的。 即双链DNA相对于单链DNA是减色的(hypochromic),反 之单链DNA相对于双链DNA是增色的(hyperchromic)

熔解曲线与Tm值 OD 1.37 1.185 1.0 ℃ Tm=℃ofC=C/2 =OD增加值的中点温度 或DNA双螺旋结构失去一半时的温度 Tm是DNA的(G+C)含量的函数

1.185 1.0 1.37 OD ℃ Tm = ℃ of Ct = C0 /2 = OD增加值的中点温度 或DNA双螺旋结构失去一半时的温度 Tm是DNA的(G+C)含量的函数。 熔解曲线与Tm值

影响Tm的因素有哪些?

影响Tm 的因素有哪些?

GC含量 。氵 溶液中的离子强度 ·为什么DNA溶液中的离子强度越高,Tm 也就越高?

• GC含量 • 溶液中的离子强度 • 为什么DNA溶液中的离子强度越高, Tm 也就越高?

·核酸在260nm处的光吸收可用于测定其浓 度。当浓度为1mgml、光程为1cm时,双 链DNA的A26O=20,RNA和单链DNA的 A260=25。 OD260/OD280可用于测定DNA纯度。 OD260/OD280=1.8为纯dsDNA,纯RNA 为2.0,蛋白小于1(一般是0.5)

• 核酸在260nm处的光吸收可用于测定其浓 度。当浓度为1mg/ml、光程为1cm时,双 链DNA 的A260=20,RNA和单链DNA的 A260=25。 • OD260/OD280可用于测定DNA纯度。 OD260/OD280 =1.8为纯dsDNA, 纯RNA 为2.0,蛋白小于1(一般是0.5)

2、常用的变性方法 ☆热变性 应用广泛,特别是用于变性动力学研究 缺点:高温引起磷酸二酯键的断裂,得到长短不一的单链 ☆碱变性 pH=11.3时,全部氢键被淘汰 无热变性的缺点,为制备单链DNA的首选方法 ©保存单链DNA的条件保持pH大于11.3 盐浓度低于0.01mol/L

2、 常用的变性方法 ☆ 热变性 ☆ 碱变性 应用广泛,特别是用于变性动力学研究 缺点:高温引起磷酸二酯键的断裂,得到长短不一的单链 pH=11.3时,全部氢键被淘汰 无热变性的缺点,为制备单链DNA的首选方法 ◎ 保存单链DNA的条件 保持pH大于11.3 盐浓度低于0.01mol/L

二、DNA分子的复性(anneal or renaturation) 概念:变性DNA在适当条件下,两条彼此分开的链又可以 重新地合成双螺旋结构的过程(退火) Denaturation D.S DNA S.S DNA Renaturation 复性过程依赖于单链分子间的随机碰撞 复性DNA分子不一定是原有的一对互补链

D.S DNA S.S DNA Denaturation ▲ ▼ Renaturation 复性过程依赖于单链分子间的随机碰撞 二、DNA分子的复性 (anneal or renaturation) 概念:变性DNA在适当条件下,两条彼此分开的链又可以 重新地合成双螺旋结构的过程(退火) ❖复性DNA分子不一定是原有的一对互补链

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