《生物信息学 Bioinformatics》课程教学资源（思维导图）第九章 蛋白质与代谢组学

澳道技术一蛋白质高通量检测肢术蛋白腰的质诺高透章鉴定凌拍色落审联质道磷酸化乙化蛋自质整译后修荐一泛歌化秘基化蛋白质组学概述一展控分析民油室定重白质数据分析流程相装与定定量统计Proteome Xchang重白质数据与软伴资源uanFindStudio重自费结构空要改蛋白质结拍摄述站比较与分类白结为可模化重自质折每网重白质结构分析二级结构预测重白质结构预测一重白质无字区预测三级结构预测功能重白质的重头没计一正到系给等温等压系综一统计力学，微正期系第2章生物统计学基础巨正则系一分子力场牛领运动方程周期性边界条件第3章深度学习与人工智能蛋自质分子动力学模拟蛋白质分子动力学模拟过程一个彩果样第1章生物信息学版念及发展历史一周车交换分子动力学高级降法一第4章生物信息资源元动力学第6章基因组学极控化建模GROMACS关联章第9章蛋白质和代谢组学第7章转录组学主滤分子动力学软件NAMD第8章转录调控和表观速传基于序列相胞性第10章表型组学第5章序列比对与分析一基于序列的功能分析基于序列的GO助格释第13章生物信息学实验基础一基于结均相织性基于结构的功能预测一基于分子对报基于压白质功能预测与分析基于层次果类基于随机滤走基于网络的功能分析基于模决宽第11章系统生物学基于覆分割一基于网整合基于机器学习基于板磁共据一代谢明学的实验技术基于肤湖代物主排183轨失值现处第12章生物信息学应用数招物换数摄控一数据标推化数据透放一家关分析一代谢明学数据分析流程一差异分析下路分析透路分析一关联分析代谢组学 XCMSMetaboAnalyst一软件和工具MS-Dial医将草阳津童和诊客一该病分类与亚型评别族病进展点测和预台评估一代谢组学应用例药物疗效评结和个体化治疗一药物肥发现一肠酒微生物格物代池

代谢组学 代谢组学的实验技术 基于核磁共振 基于质谱 代谢组学数据分析流程 生成数据矩阵 代谢物注释 峰检测 数据质控 缺失值填充 数据转换 数据标准化 数据缩放 下游分析 聚类分析 差异分析 通路分析 关联分析 软件和工具 XCMS MetaboAnalyst MZmine MS-Dial 代谢组学应用实例 疾病早期筛查和诊断 疾病分类与亚型识别 疾病进展监测和预后评估 药物疗效评估和个体化治疗 药物靶标发现 肠道微生物 植物代谢 蛋白质功能预测与分析 基于序列的功能分析 基于序列相似性 基于序列的GO功能注释 基于结构的功能预测 基于结构相似性 基于分子对接 基于网络的功能分析 基于邻域 基于层次聚类 基于随机游走 基于模块度 基于图分割 基于网络整合 基于机器学习 蛋白质分子动力学模拟 统计力学 正则系综 等温等压系综 微正则系综 巨正则系综 分子力场 牛顿运动方程 周期性边界条件 蛋白质分子动力学模拟过程 高级算法 伞形采样 副本交换分子动力学 元动力学 粗粒化建模 主流分子动力学软件 GROMACS NAMD 蛋白质结构分析 蛋白质结构概述 蛋白质结构组织层次 结构比较与分类 蛋白质结构可视化 蛋白质结构预测 蛋白质折叠问题 二级结构预测 蛋白质无序区预测 三级结构预测 功能蛋白质的重头设计 蛋白质组学概述 蛋白质高通量检测技术 质谱技术 蛋白质的质谱高通量鉴定 液相色谱串联质谱 蛋白质翻译后修饰 磷酸化 乙酰化 泛素化 糖基化 蛋白质数据分析流程 质控分析 质谱鉴定 组装与定量 定量统计 蛋白质数据与软件资源 Proteome Xchange MaxQuant pFind Studio 第1章 生物信息学概念及发展历史 第4章 ⽣物信息资源 第6章 基因组学 第7章 转录组学 第8章 转录调控和表观遗传 第10章 表型组学 第13章 生物信息学实验基础 关联章节 第9章 蛋白质和代谢组学 第2章 ⽣物统计学基础 第3章 深度学习与⼈⼯智能 第5章 序列比对与分析 第11章 系统生物学 第12章 生物信息学应用