《生物信息学 Bioinformatics》课程教学资源（思维导图）第十三章 生物信息学编程

生物信息学编程目的—生物信息学编程技术发展编程概述常用端程语育ChatGPT的用定性和性胎一开蒙软件生态系抗强大的诊令行工具Linux操作系镜—软件包管理和更新—社区和支持自定文和灵活性Shell*Shell变量—Shell条件坏送句Shell脚本编程Shellt通e款 ShellShelimi道ShellI量定内第1章生物信惠学概念及发展历史—R透真的安装Linux系统及编程语言简介第2章生物统计学基础R包的管理第3章深度学习与人工智能数据更型和数据结构R透高基本透法第5章序列比对与分析—R编程语高数据选择与操作第6章基因组学一管道授作特关联费专第13章生物信启学实验基础第7章转录组学强大挖计分析始力第8章转录调控和装观遇传年富的可损化功能第9章蛋白质和代谢组学需用的生物信息学软件包厂Python安装与使用第10章表型组学—Python包的安装与使用第11章系统生物学—Python基本透法第12章生物信息学应用Python端程语膏Python数摄维作Python可提化Python生物信息学软件你一基于Shell的分析流程Snakemakepef数据分析流程搭建基于Snakemake的分析流理Snakemale使用方送Snakemake实制分析折广关系型数据库框念数期验案和分析一关系型数据库介绍数据管理和维护数彩库管理系厂文档数库第4章生物信息资源数据库开发基础列数照车一半关系型数据库介照一键值存笔图数率一数据库开发简介数据库开发实戏

数据库开发基础 关系型数据库介绍 关系型数据库概念 数据检索和分析 数据管理和维护 数据库管理系统 ⾮关系型数据库介绍 ⽂档数据库 列族数据库 键值存储 图数据库 数据库开发简介 数据库开发实践 数据分析流程搭建 基于Shell的分析流程 基于Snakemake的分析流程 Snakemake简介 Snakemake使⽤⽅法 Snakemake实例分析 Linux系统及编程语⾔简介 Linux操作系统 稳定性和性能 开源软件⽣态系统 强⼤的命令⾏⼯具 软件包管理和更新 社区和⽀持 ⾃定义和灵活性 Shell脚本编程 Shell脚本 Shell变量 Shell条件循环语句 Shell传递参数 Shell函数 Shell管道 Shell重定向 R编程语⾔ R语⾔的安装 R包的管理 数据类型和数据结构 R语⾔基本语法 数据选择与操作 管道操作符 强⼤统计分析能⼒ 丰富的数据可视化功能 常⽤的⽣物信息学软件包 Python编程语⾔ Python安装与使⽤ Python包的安装与使⽤ Python基本语法 Python数据操作 Python可视化 Python⽣物信息学软件包 编程概述 ⽣物信息学编程⽬的 ⽣物信息学编程技术发展 常⽤编程语⾔ ChatGPT的应⽤ 第1章 生物信息学概念及发展历史 第2章 ⽣物统计学基础 第3章 深度学习与⼈⼯智能 第5章 序列比对与分析 第6章 基因组学 第7章 转录组学 第8章 转录调控和表观遗传 第9章 蛋白质和代谢组学 第10章 表型组学 第11章 系统生物学 第12章 生物信息学应用 关联章节 第13章 ⽣物信息学实验基础 第4章 ⽣物信息资源