《生物信息学 Bioinformatics》课程教学资源（思维导图）第八章 转录调控与表观遗传

DNAR净列位营提事能练一美事因子结合要体零示方造E特学围子结色模从头发销特单因子结台领体从实发现TMSR万3转录调控分析基子者有游样国方法P-Seq8388号CHP-q5系表务结号Chp-Seg热能分板方法提测特学国子程基园CHP-Seq能E主样RBR方法DNA甲基化免度其究究方法勇手代别净方法处热量控制DNA甲基化组学数提分析净对WGBS数期分折方造DNA基化水手EE祖导甲基R区城定美1章生物信息学器念及发服质史爱具甲美R区球主排X-ChiP-Se第2章生物统计学基陷-CHP-SesaTUNBCUTaTa美3章深建学习和人工智组量白修饰绍学数据分折生用星的我通白学的在美区城第8章转录调控和表观遇传格重自排据分折方法第4章生物信息炎源白学保能择集区城基于电图白学的用彩公色态第5章序列比对与分折第6章基国指学彩序方洁第11毫系统生物学ChIA-PET第7章转录组学余色医柜在用计算第12章生物信息学应用C器时我化美9意宝白质和代密用学RRR色国区室三服器品学分8第13章生物信息学实验基法三能基医学股据分析方法R色结特RRR色sRR色排基国BB款一能作MsRNAEMRR及手型温合型修荐基子OR化子反精学小牛件表现转票拍学用究方造基子对化学家#消化技生带明学得分折Km代RRRNA修言集究城RA单控点二表转票学教提分析方造美地RA修物位点ERNASsaae

表观转录组学数据分析 RNA修饰的定义及类型 碱基修饰 核糖修饰 混合型修饰 表观转录组学研究方法 基于亲和纯化 基于反转录诊断事件 基于对化学或酶消化抗性 第三代测序 表观转录组学数据分析方法 识别RNA修饰富集区域 识别RNA修饰单位点 鉴定RNA修饰位点 鉴定RNA修饰 绘制RNA修饰位点的分布特征 三维基因组学数据分析 测序方法 Hi-C ChIA-PET 三维基因组学数据分析方法 染色质相互作用矩阵计算 Hi-C数据可视化 识别染色质区室 识别染色质拓扑结构域 识别染色质环 识别染色体重排 基因组组装 组蛋白修饰组学数据分析 测序方法 X-ChIP-Seq N-ChIP-Seq CUT&RUN和CUT&Tag 组蛋白修饰数据分析方法 注释层面的ChIP-Seq数据质量控制 识别组蛋白修饰富集区域 识别组蛋白修饰差异富集区域 基于组蛋白修饰图谱推断染色质状态 DNA甲基化组学数据分析 测序方法 亚硫酸盐转化方法 DNA甲基化免疫共沉淀方法 第三代测序方法 WGBS数据分析方法 原始数据质量控制 序列比对 DNA甲基化水平推断 差异甲基化区域鉴定 差异甲基化区域注释 转录调控分析 转录因子结合模体表示方法 DNA共有序列 位置频率矩阵 序列标识图 转录因子结合模体从头发现 转录因子结合模体从头发现 基于EM算法的识别方法 基于吉布斯抽样法的识别方法 ChIP-Seq数据分析方法 识别ChIP-Seq数据信号峰 识别ChIP-seq数据差异信号峰 预测转录因子靶基因 ChIP-Seq数据功能注释 第8章 转录调控和表观遗传 第7章 转录组学 第1章 生物信息学概念及发展历史 第2章 生物统计学基础 第3章 深度学习和人工智能 第4章 生物信息资源 第6章 基因组学 第9章 蛋白质和代谢组学 第11章 系统生物学 第12章 生物信息学应用 第13章 生物信息学实验基础 第5章 序列比对与分析