《生物信息学 Bioinformatics》课程教学资源（思维导图）第四章 生物信息资源

NCBl-GenBank EBI-EMBL—DNA序列数库NIG-DDBJCNCB-NGDCEBI-Ensembl一基因组数据库NCBI>RefSeqGO基遇本体KEGG代密通路一功能基因数据库DNA数据库COG同基因 dbGap基因型与表型致据库GWASNCBI-GEODDBJ-GEA基因表达致据库EBl-ArrayExpressCNCB-GENEPD自动子功能元件数据库ENCODE第5章序列比对与分析 Rfam一综合数据军RNAcentral第6章基因组学RNAmod1RNA数据库特定数据库RNALocate胞定位第1章生物信息学概念及发屏历史第7章转录组学miRBase非编码RNA数据库一starBase第12章生物信息学应用第4竞生物信良资源 UniProt第8章转录调控和装观造传重白质与基因InterProExpasy第13章生物信息学实验基错第9章蛋白质和代谢组学CATH一蛋白质分类与注释PRINTSPDB第10章表型组学蛋白质空间结购一.CCDC蛋白质数据库IntAct第11章系统生物学MINT蛋白质互作BioGRIDSTRINGBRENDA酶数据库CAZy果线FlyBase继虫WormBase模式动物ugXenbase小MGI班马鱼ZFIN植物代密组GMD物神特异性数据膚植物基器料Phytozome招电齐数盗测库TAIR细定病毒生物信资源率BV-BRC微生物完原组学资源整合系统PATRIC—流感基因电其享教据库GISAID

物种特异性数据库 模式动物 果蝇FlyBase 线虫WormBase 爪蟾Xenbase 小鼠MGI 斑马鱼ZFIN 植物 植物代谢组GMD 植物基因组Phytozome 拟南芥数据资源库TAIR 微生物 细菌病毒生物信息资源库BV-BRC 病原组学资源整合系统PATRIC 流感基因组共享数据库GISAID 蛋白质数据库 蛋白质与基因组 UniProt InterPro Expasy 蛋白质分类与注释 CATH PRINTS 蛋白质空间结构 PDB CCDC 蛋白质互作 IntAct MINT BioGRID STRING 酶数据库 BRENDA CAZy RNA数据库 综合数据库 Rfam RNAcentral 特定数据库 RNAmod修饰 RNALocate亚细胞定位 非编码RNA数据库 miRBase starBase DNA数据库 DNA序列数据库 NCBI-GenBank EBI-EMBL NIG-DDBJ CNCB-NGDC 基因组数据库 EBI-Ensembl NCBI-RefSeq 功能基因数据库 GO基因本体 KEGG代谢通路 COG同源基因 基因型与表型数据库 dbGaP GWAS 基因表达数据库 NCBI-GEO DDBJ-GEA EBI-ArrayExpress CNCB-GEN 功能元件数据库 EPD启动子 ENCODE 第4章 生物信息资源 第1章 生物信息学概念及发展历史 第5章 序列比对与分析 第6章 基因组学 第7章 转录组学 第8章 转录调控和表观遗传 第9章 蛋白质和代谢组学 第10章 表型组学 第11章 系统生物学 第12章 生物信息学应用 第13章 生物信息学实验基础