复旦大学：《药物设计学》课程教学资源（课件讲稿）第五章 药物发现的虚拟筛选方法 Virtual screening in drug discovery

第5章药物发现的虚拟筛选方法 Virtual screening in drug discovery VIRTUAL SCREEN Target protein SCREEN HIGH-THROUGHPUT SCREEN molecule library Test high-scoring Test all nolecules olecules

1 第 5章 药物发现的虚拟筛选方法 Virtual screening in drug discovery

第一节概述 化合物库 匹配 计算 搜寻标准 命中结构Hits (提问结构) 搜寻标准 搜寻的基本要素化合物库 计算方法

2 匹配 计算 命中结构 Hits 第一节 概述 搜寻标准 (提问结构) 搜寻的基本要素 搜寻标准 化合物库 计算方法

根据搜寻标准和计算方法,分为二类基本方法: 直接法 =基于靶点结构 基于分子对接( docking-based) 间接法 =基于配体相似性( ligand similarity- based) =基于药效团( pharmacophore- based)

3 根据搜寻标准和计算方法，分为二类基本方法： 直接法 = 基于靶点结构 = 基于分子对接（docking-based) 间接法 = 基于配体相似性（ligand similarity-based ） = 基于药效团（pharmacophore-based)

合成化合物库 天然化合物库 化合物 数据库 组合化合物库 药物分子库 类药性化合物库 生物大分子{核酸分子库 数据库 蛋白质分子库

4 化合物 数据库 合成化合物库 天然化合物库 组合化合物库 药物分子库 类药性化合物库 生物大分子 数据库 核酸分子库 蛋白质分子库

化学信息和生物信息计算机系统 利用计算机信息处理系统对分子 小分子及生物大分子)(2D及3D) 及相关信息(性质、来源、用途)进行 分析、储存、检索和传递等处理 小分子化合物匹配计第 生物大分子 化学信息学 生物信息学 命中结构

5 化学信息和生物信息计算机系统 —— 利用计算机信息处理系统对分子 （小分子及生物大分子）（2D 及3D ） 及相关信息（性质、来源、用途）进行 分析、储存、检索和传递等处理 小分子化合物 生物大分子 命中结构 化学信息学 生物信息学 匹配计算