《生物多样性导论》课程教学课件(PPT讲稿)17 遗传多样性

③遗传变异的度量和分析 致命的缺点:就是通过对表型性状的研究,我们所能准确 分析的基因位点都太少,因而不能客观地估计遗传变异性。 首先,当采用符合孟德尔遗传的质量(单基因)性状为遗 传标记时,尽管可以确定编码这些性状的基因位点,但这类简 单遗传的性状在生物类群的众多性状中所占比例很小,反映的 基因位点太少,因此仍不能作为整个基因组的代表,从而不能 客观地反映遗传变异水平。 对能充分反映基因组,受多基因编码的数量性状来说,我 们目前也只能大致估算“有效因子”的数目
③遗传变异的度量和分析 致命的缺点: 就是通过对表型性状的研究,我们所能准确 分析的基因位点都太少,因而不能客观地估计遗传变异性。 首先,当采用符合孟德尔遗传的质量(单基因)性状为遗 传标记时,尽管可以确定编码这些性状的基因位点,但这类简 单遗传的性状在生物类群的众多性状中所占比例很小,反映的 基因位点太少,因此仍不能作为整个基因组的代表,从而不能 客观地反映遗传变异水平。 对能充分反映基因组,受多基因编码的数量性状来说,我 们目前也只能大致估算“有效因子”的数目

2.2染色体水平 与形态学变异不同,染色体变异(畸变)必然导致遗传变 异的发生,是生物遗传变异的重要来源。包括:染色体在数目 、染色体组型特征和结构上的变异。 巨型月见草 2n=28 月见草 2n=14 在任何生物类群的天然居群中都存 在或大或小的染色体变异,这些变异在 进化过程中起着十分重要的作用
2.2 染色体水平 与形态学变异不同,染色体变异(畸变)必然导致遗传变 异的发生,是生物遗传变异的重要来源。包括:染色体在数目 、染色体组型特征和结构上的变异。 在任何生物类群的天然居群中都存 在或大或小的染色体变异,这些变异在 进化过程中起着十分重要的作用。 月见草 巨型月见草 2n=28 2n=14

2.3等位酶水平 等位酶是由等位基因编码的同工酶,是借助于特定的遗传 分析方法确定的一种特殊的同工酶。由于等位酶谱带同等位基 因之间的明确关系,使其成为一种十分有效的遗传标记,建立 了度量遗传变异和居群遗传结构的定量指标,使整个生物界遗 传多样性的研究结果可以在共同的基础上进行比较。 etals 拟南芥 odicel 刚松 多态位点比率为0.165 多态位点比率高达0.966
2.3 等位酶水平 等位酶是由等位基因编码的同工酶,是借助于特定的遗传 分析方法确定的一种特殊的同工酶。由于等位酶谱带同等位基 因之间的明确关系,使其成为一种十分有效的遗传标记,建立 了度量遗传变异和居群遗传结构的定量指标,使整个生物界遗 传多样性的研究结果可以在共同的基础上进行比较。 多态位点比率为0.165 拟南芥 刚松 多态位点比率高达0.966

2.4DNA水平 分子生物学和分子克隆技术的发展又带来了一系列更为 灵敏和有效的遗传多样性检测方法,从技术上达到了可以对 生物基因组中的任何片段进行分析。因此,分子水平上的遗 传标记可以说是无限的
2.4 DNA水平 分子生物学和分子克隆技术的发展又带来了一系列更为 灵敏和有效的遗传多样性检测方法, 从技术上达到了可以对 生物基因组中的任何片段进行分析。因此,分子水平上的遗 传标记可以说是无限的

DNA分子标记 DNA分子标记是以DNA多态性为基础的遗 传标记 以品种DNA片段作为检测对象 用电泳方法检测基因组DNA结构与组成的 差异
DNA分子标记 ▪ DNA分子标记是以DNA多态性为基础的遗 传标记 ▪ 以品种DNA片段作为检测对象 ▪ 用电泳方法检测基因组DNA结构与组成的 差异

分子标记的种类 Y RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism):限制性片段长度多态性 ySSR(Simple Sequence Repeat):简单重复序 列 Y RAPD (Random Amplified Polymorphism DNA):随机扩增多态性DNA Y AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism):扩增片段长度多态性 YSNP(single nucleotide polymorphism)单核 苷酸多态性 ●●●●●
分子标记的种类 RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism):限制性片段长度多态性 SSR(Simple Sequence Repeat):简单重复序 列 RAPD(Random Amplified Polymorphism DNA):随机扩增多态性DNA AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism ):扩增片段长度多态性 SNP(single nucleotide polymorphism)单核 苷酸多态性

DNA分子标记 利用分子标记的多态性可以检测品种基因组结 构的变异(DNA标记 结构变异) 通过对分子标记确定的遗传距离,进行主成、 份分析或聚类分析,可以研究种质的类群 (标记数据一遗传距离聚类分析 类群
DNA分子标记 ▪ 利用分子标记的多态性可以检测品种基因组结 构的变异 (DNA标记 结构变异) ▪ 通过对分子标记确定的遗传距离,进行主成、 份分析或聚类分析,可以研究种质的类群 (标记数据 遗传距离 聚类分析 类群)

12 4小6 分子标记(引物)电泳结果
分子标记(引物)电泳结果

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100个RFLP和SSR标记在玉米染色体上的位置

187个自交系的聚类分析 A类 B类 1.00 0.80 0.60 0.40 0.20 Lines ■PA PB ■LRC,Lvda Red Cob A B D ■BSSS ■Lan SPT,Sipingtou Xie et al,2008
187个自交系的聚类分析 A类 B类 Xie et al,2008
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