中国科学院：超级计算平台Linux初级培训（PPT讲稿，2009.11）

QIBEBT国科字院青岛生物能源与过程研我所(筹 超级计 级培训 培训时间:2009.11.12

培训时间：2009.11.12 1 超级计算平台Linux初级培训

课程简介 QIBEBT 本课程为超算平台培训课程之 课程內容: Linux操作系统的初级培训 培训对象:所内所有人员 培养目标:此培训纲要针对 Linux.入门级学习,使大 家能够独立装mu非进行简笔的系统维#

2 本课程为超算平台培训课程之一 课程内容：Linux操作系统的初级培训 培训对象：所内所有人员 培养目标：此培训纲要针对Linux入门级学习，使大 家能够独立安装Linux，并进行简单的系统维护； 掌握Linux操作系统的相关基础知识及一些常用的 命令。 课程简介

目录 QIBEBT 前言:超算平台简单介绍 第一章: Linux操作系统简介 第二章: Linux操作系统安装和基本配置 第三章: Linux操作系统的文件系统结构 第四章: Linux操作系统的用户管理 第五章: Linux操作系统常用命令详解 第六章: Linux操作系统的进程管理

3 前言：超算平台简单介绍 第一章：Linux操作系统简介 第二章：Linux操作系统安装和基本配置 第三章：Linux操作系统的文件系统结构 第四章：Linux操作系统的用户管理 第五章：Linux操作系统常用命令详解 第六章：Linux操作系统的进程管理 目录

超算平台职责 QIBEBT 超算平台的建设、运行维护 ◇对超算用户提供必要的技术支持 科学计算及可视化方面的开发、移植、优化、改编 服务器及存储托管 ◇定期的技术培训 网站:http://124.16.151.186 邮箱:scc@ qibebtaccn

4 ◇ 超算平台的建设、运行维护 ◇ 对超算用户提供必要的技术支持 ◇ 科学计算及可视化方面的开发、移植、优化、改编 ◇ 服务器及存储托管 ◇ 定期的技术培训 超算平台职责 网站：http://124.16.151.186 邮箱：scc@qibebt.ac.cn

超算平台简介 QIBEBT 主要由曙光集群构成,总计算能力达每秒3.6万亿次: 计算刀片:38台TC2600,各两颗主频2.1GHz的 AMD Opteron2352 x86_64四核处理器,16GB内存,总运算能力为每秒2.55万亿次 胖节点服务器:两台A950r-F,各八颗主频2.2GHz的 AMD Opteron 8354x8664四核处理器,64GB内存,总运算能力每秒0.56万亿次 I0兼计算节点:六台A620r-FX,各两颗主频2.1GHz的 AMD Opteron 2352x8664四核处理器,8GB内存,总运算能力每秒0.4万亿次 管理和用户登录节点,各一台A620r-FX,每台两颗主频2.1GHz的AMD Opteron2352x86_64四核处理器,16GB内存,总运算能力每秒 0.13万亿次 计算网络:单向10Gb/s的 Infiniband和千兆以太网 存储与备份:5TB的 HDS WMS100存储各一台 操作系统: Red Hat Enterprise linux Server5.3 编译器:x860pen64、 Intel、PGI、GNU等C/C++ Fortran编译器 数值函数库:ACML、 Intel mKl及 Goto blas、 ATLAS、BLAS Scalapack等 并行计算环境: Open mPi, MVAPICH及0penP,支持节点间MPI并行 和节点内共享内存的0 penMP并行 5

5 超算平台简介 主要由曙光集群构成，总计算能力达每秒3.6万亿次： ● 计算刀片：38台TC2600，各两颗主频2.1GHz的AMD Opteron 2352 x86_64四核处理器，16GB内存，总运算能力为每秒2.55万亿次 ● 胖节点服务器：两台A950r-F，各八颗主频2.2GHz的AMD Opteron 8354 x86_64四核处理器，64GB内存，总运算能力每秒0.56万亿次 ● IO兼计算节点：六台A620r-FX，各两颗主频2.1GHz的AMD Opteron 2352 x86_64四核处理器，8GB内存，总运算能力每秒0.4万亿次 ● 管理和用户登录节点，各一台A620r-FX,每台两颗主频2.1GHz的AMD Opteron 2352 x86_64四核处理器，16GB内存，总运算能力每秒 0.13万亿次 ● 计算网络：单向10Gb/s的InfiniBand和千兆以太网 ● 存储与备份：5TB的HDS WMS100存储各一台 ● 操作系统：Red Hat Enterprise Linux Server 5.3 ● 编译器：x86 Open64、Intel、PGI、GNU等C/C++ Fortran编译器 ● 数值函数库：ACML、Intel MKL及Goto BLAS、ATLAS、BLAS、 ScaLapack等 ● 并行计算环境：Open MPI，MVAPICH及OpenMP，支持节点间MPI并行 和节点内共享内存的OpenMP并行

作业运行情况 QIBEBT Long queue Fat queue: Serial queue: Total queue ustcluo: 32330 所内用户 所外用户 8 生物信息学、中国科学技术大学、 预处理 中科院海洋所 mangas: 10596 14571h 热化学等 中科院宁波所、 hongcam: 20827h 宏剑公司等 hmi:69607h 连续8个多月稳定运行 6

6 作业运行情况 所内用户 所外用户 17 8 生物信息学、 预处理、 热化学等 中国科学技术大学、 中科院海洋所、 中科院宁波所、 宏剑公司等 连续8个多月稳定运行

作业运行情况 QIBEBT 所有队列的总和 所有队列的总和 12:00 五00:00 口运行中的作业所占用的核数■等待运行的作业所需的核数被挂起的作业所占用的核数‖日运行中的作业所占用的核数■等待运行的作业所需的核数口被挂起的作业所占用的核 天统计 周统计 (2009年7月17日) 所有队列的总和 所有队列的总和 名 . o WA Week 26 Week 29 8月9月10月11月12月1月2月3月4月5月6月7月 目运行中的作业所占用的核数■等待运行的作业所需的核数口被挂起的作业所占用的核数口运行中的作业所占用的核数■等待运行的作业所需的核数口被挂起的作业所占用的核数 月统计 年统计

7 作业运行情况 一年统计 一周统计 一月统计 一天统计 （2009年7月17日）

目录 QIBEBT 第一章: Linux操作系统简介 第二章: Linux操作系统安装和基本配置 第三章: Linux操作系统的文件系统结构 四.第四章: Linux操作系统的用户管理 五.第五章: Linux操作系统常用命令详解 六.第六章: Linux操作系统的进程管理

8 一．第一章： Linux操作系统简介 二．第二章： Linux操作系统安装和基本配置 三．第三章： Linux操作系统的文件系统结构 四．第四章： Linux操作系统的用户管理 五．第五章： Linux操作系统常用命令详解 六．第六章： Linux操作系统的进程管理 目录

QIBEBT 第一章: Linux操作系统简介

9 第一章：Linux操作系统简介

第一章: Linux操作系统简介 QIBEBT inux以它的高效性和灵活性著称。具有多任务、多用户 的能力。 Linux之所以受到广大计算机爱好者的喜爱,其主要原因 有两个,一是它属于自由软件,用户不用支付任何费用就可 以获得它和它的源代码,并且可以根据自己的需要对它进 必要的修改。另一个原因是,它具有Unix的全部功能,任 何使用Uniⅹ操作系统或想要学习Uniⅹ操作系统的人都可 以从 Linux中获益。 10

10 • Linux 以它的高效性和灵活性著称。具有多任务、多用户 的能力。 • Linux 之所以受到广大计算机爱好者的喜爱，其主要原因 有两个，一是它属于自由软件，用户不用支付任何费用就可 以获得它和它的源代码，并且可以根据自己的需要对它进行 必要的修改。另一个原因是，它具有 Unix 的全部功能，任 何使用 Unix 操作系统或想要学习 Unix 操作系统的人都可 以从 Linux 中获益。 第一章：Linux操作系统简介