复旦大学：《医学信息检索与利用》课程教学资源（案例）07 关于幽门螺旋杆菌引起胃癌的研究进展

复旦大学上海医学院 2014~2015学年第一学期期末考试试卷 课程名称:医学文献检索与利用B课程代码:MED|30087.01 开课院系:图书馆文献检索教研室考试形式:调研报告 姓名:王海学号:13301010018专业:临床医学五年制 3试卷总分学期总评 得分 复旦大学 信息检索与利用 综合实习报告 (医学本科生选修版) 检索题目(中英文)关于幽门螺旋杄菌引起胃癌的硏究进展 The study of the helicobacter pylori-induced gastric cancer 考生姓名_王海学号13301010018 学科专业临床医学五年制报告完成日期2014年12月9日

!t£L::k~L~~~~ 2014"'-J2015 ~~~-~MM*~~~15 ~~~~: __~~~~~·X~~~~~.~~~~~~~ffl~B~ ~~~~: MED130087.01 *~~~: __~oo~~~m=x~~~~~"~~,~~~M~~~ ~i.l\~:it : iJ]fM1~H!i· fti ~: ItHi ~ %: 13301010018 ~: IVsIi*~-r1i~ft~ {feJ-r]b ~-A:r 1t,t~'tlEj ;f'J Jf) !*~~:q~ft% ( I!# ~,ft1-i!11}Jt&. ) The study of the helicobacter pylori-induced gastric cancer '+ ~ 13301010018 --====-=---­

对课题开展初步探究 工欲善其事,必先利其器。 《论语·卫灵公》 如果我们把科研看成是我们的“事”的话,那文献检索就是我们的“器”,只有 对现有的中外文文献资料进行全面准确的查找与阅读才能进行科研的设计与实 施 然而,如果我们把文献检索看成是我们的“事〃的话,那我们对所选课题的知 识储备就是我们的“器〃。假如我们对我们的课题没有充分的知识储备而贸然进行 文献检索的话,很有可能会使得文献检索不够全面与准确 因为我仅仅是大二的学生,刚接触医学,对"幽门螺旋杆菌引起胃肿瘤”这个 课题的知识显然不够,在前期的检索中也走了很多弯路。但当我发现自己的不足 之后,我决定恶补医学知识,为接下来的文献检索工作打好基础 以我的课题为例,检索需要的知识储备有以下几个方面 1.专业名词的查全 通过阅读大量中外文文献的标题和摘要,了解不同作者惯用的专业名词, 例如" helicobacter pylo"“H, pylori”都是幽门螺杆菌的不同表达方式。幽 门螺杆菌还曾经因为形态学上的相似性在20世纪的时候被分到弯曲菌 的属中,曾用名 Campylobacter pylori 2.专业名词的从属关系 cagA"是幽门螺杆菌的一种细胞毒素相关基因,是从属于幽门螺杆菌下 的一个子概念,检索的时候应该注意添加。 3.专业名词的分类 胃肿瘤是一个器官的肿瘤,胃肿瘤有许多的分类方法,包括按部位分可 分为“贲门癌”,“胃底癌”,“幽门癌”,按肿瘤所在的组织可分为“腺癌” 鳞癌”,“平滑肌癌”等等。在检索的时候应当检索专有名词的各个类別

~i*J!~}r ~:fJ) 4*-~ .I..~~Jt..., ~. jc;;f'J Jt.. 0 ~a*~1f1;J"e.#$;If:t ~~~11'1 61 "*" 61-£-&- , fJ~ :z,,*#1:-~ :i,tit~ 11'161" 2-", J{;t ~m;t61 rf 7r :Z:Z,,*;~;f+*At1::-oo;lt~61 ~~~~ l)tl~ t ~btt1t#$;Ifa~-i~:it~ ~ fA r1Q, ~a*~1(J;J"e.:Z,,*#1:-~:t ~~~11'161"*"611-5, fJ~~ 1n~ pJf~i*l!61~ -if..1it--i-:i,t~~ 1i1~" 2-" 0 ffl~~1n~ 1n 61i*l!).t;t Jt.-)f-61~t1-if..1it--i-r1Q fAiifAt :z,,*#1:-~ 611-5, ,ftl;tiif~~i'-1~iJt :Z"*#1:-'t. ~~1::-oo Ej ;It,6!ij. I!l :JJ~~~~*--=-61!f1.., ~'J.lk,ik ~!f, ~"~ f1*.~~~fM" 51 1ff~"it1' i*l!61~t1-if..1f.~ ~~, '{£:;Vr.J!JJ 61#1:-:t rf ~*- 7 ftl~ ~o 1!L ~iOJt t1 c..61 ~Jt zJ{;, ~J!:~.~:f~ !f~-if.., :JJ f.l-r Al61 :z,,*#1:-~ .:r.tt .tr*~!:4o ~~61*l!~~, *~*~61~~1it--i-;t~r~1'~OO: 1. -t~.t. i.iJ ~1:: ffHa"helicobacter pylori" "H.pylori" -tF~iIt:t f1 *.~~f 61 lii]ilii~ 1(.. ~ f1 ~ffM" iftf t1.1!l 7F}~!f J:.61*~1~)Ail£ 20 i!ttc..61 Rt1~;fJt-)f-j'J db M" 61J4 rf, tf ffl;g Campylobacter pylori. 2. -t~;g j.iJ ~~,£* ~ "cagA"~iIt:t n~ffM"61-#~JJe.*:t*~*~I!l, itM.J4T~ n *.~ffM"r 61-1'~.~,#1:-~61Rt~S~~.~~o 3. -t~.t. j.iJ ~ Iff1'iUt.- l'2-l'61 Iff~, Iff ;t-it 61;} ~t. , ~?A-&-~·iHj. -)f-tif ;}~II-tnf.%", "~~f.%", flilt:tf1~", ~1ff~pJf,(f61g11miif-)f-~"J1if.%", 1I~#ff.%", "f-~ JlJLf.%"~~ 0 1£.#1:-~ 61 Rt1~S :ki *~t1f;g i~ 61 ~1'~ ~lJ. 2

我的前期的知识储备工作主要分为三个部分 1.在网上利用中外文的检索平台,粗查相关度高的文献,阅读标题与摘要 提取对检索有帮助的信息,包括利用CBM查找英文同义词等。这种方式 已经在课堂上多次分析,在此不赘述。 2.利用图书馆的实体书资源,选择权威的书籍,对相关的概念进行查阅 了解课题的背景知识,这样能够搭建对专业知识的信息框架,使得文献 检索有的放矢 实体书的选取: [1]闻玉梅.现代医学微生物学[M].上海医科大学出版社,1999352-368 [2 Feldman M, Friedman LS, Brandt L Sleisenger and Fordtran's gastrointestinal and liver disease: pathophysiology, diagnosis, management, expert consult premium edition-enhanced online features[M]. Elsevier Health Sciences, 2010: 732-743, 829-858 [3]萧树东许国民中华胃肠病学[M].人民卫生出版社,2008:276-283, 382-480 [4]胡伏莲,周殿元,幽门螺杆菌感染的基础与临床(第三版)M].中国科 学技术出版社,2009:276283,382-480 实体书的查询 lawrences, Teim n Gastrointestina and Liver Disease P呢4k减x:1 了hEit volume t 限也

~~~~~~~.~~~~~~~~+~~: 1. ..f£ f#] J:A'Jft] tf ~r ~lr?~*-f ~, ;br.*;f~*J.t jij lr? ~I*, ,3t]~;f;FMl:j 41ii~, A~~~~~.M~~~,~~~ft]rnM*~~~M~~~.~#*~ ~ft~*~~J~~#, ~~~*~. 2. ~IJft] (fJ~1'tlr?~#"-~1f~, i&!f:~~lr?~ti, ~;fEl*~m~i!+f (itj, 1" fii!f-i*M ;iff -;f. ~1Y-, ~;f+~~ ~~~~~ -t -*-~f1-iY- ~1t ,~.Afi *-, 1tf!t;i:rkt ~~~~~t~. ~#-.:f;~~~: [1] 1j}}.J.,.;#t. JJi!,1\!!~~t1Ah [M]. ~~!!:Hk~tl:n~.A±, 1999:352-368 [2] Feldman M, Friedman L S, Brandt L J. Sieisenger and Fordtran's gastrointestinal and liver disease: pathophysiology, diagnosis, management, expert consult premium edition-enhanced online features[M]. Elsevier Health Sciences, 2010:732-743,829-858 [3] Jl-M t,-i-tl!1 1'\.. tf 1f M1~ ~[M].A.J\.. J!.1.. tl: #&A±, 2008:276-283, 382-480 [4] t}] 1kil, ffiJ~.it. f111.'-#ilj ~~ £$:&l:j II~ ff..(tf; ~Ji&.)[M]. tf l!1 # ~~t* tl: Ji&.;;j.±, 2009:276-283,382-480 #- .:f; iij :

3.咨询相关科研组的老师,了解专有名词的概念,有助于提高文献检索的 专业性,和不同研究方向的老师沟通能够为我们搭建知识体系提供多角 度的视角,为文献检索提供帮助。因为我们现阶段没有专门的导师负责 我们的科研,所以我咨询对象有些广泛:解剖学系的王劼教授,组织与 胚胎学系的吴教授与李艳老师,病理系的李教授。其中由于吴教授与李 教授不是直接负责我平时课程的老师,所以我不太方便询问他们的全名 他们都站在自己学科的角度给我讲解了很多关于“幽门螺杆菌引起胃肿 瘤”的知识背景,给我的文献检索很大的启发。非常感谢以上几位老师的 帮助

3. ;§'"iiJ:f~ *-#"Jftll. ::t gifl , 1 fllt -t -i~ 61 {gt;t- , Jlh -t{;l :Z~~%" 61 -t AI:: ·t± , :f: Iii) hJf 1C 7[ fa] 61 ::t ~ifl )1:] J!. ~e-. 11 1rJ.ft ~p-iY- #. {;l1*-J, JlJ ~61~JlJ, 11:Z~~%"{;l1*-~~. ~11~ffi~~a~~-tn61~~~* ~ili61#~, M~~~~~~~~~~: .~*~61£~.~, tt~~ ¥~*~61~.~~~~::t~, ~~~61~.~. ~~~-t~.~~~ .~~:f: Jt1i..4 ~ * -t ati*-:f.I 61::t ~ifl, fJf YA ~:f::k..7i 1~-i~ fa) 1t!!.1fJ 61 ~ 1t!!.1fJ ~j,5~ mG*:t+61 JlJ Jt#}~i#-fllt 11~J, *- -til&! n *~#11l51 'tl tJf ~"61~piy-.:lff-!-, #}~61 :Z~~%"1&'k61 ,g;l(. ~f'f ~*YALJL1i:.~~ifl61 ~Jlh ! 4 0

核心检索系统检索 根据你的信息调研课题,搜集与课题相关的文献。核心检索系统检索可以帮 助你全面、高效地查找相关文献 1. 检索语句:(" Helicobacter/ etiology"Mesh]OR" Helicobacter/ microbiology"[Mesh] OR"Helicobacter/pathogenicity"[Mesh] OR"Helicobacter/physiology"[Mesh])AND (Gastri*[TIAB] OR Gastroe*[TIAB]OR Gastroi*[TIAB]OR STOMACH[TIAB] OR FUNDUS[TIAB] OR CARDIA"[ J)AND (cancer[TIAB] OR carcinoma[TIAB] or Neoplasms[ TIAB] OR LYMPHOMAS[TIAB] OR Leiomyoma[TlAB] oR adenoma tabl OR schwannoma[TIAB] OR TUMOR[TIAB))OR (("Stomach Neoplasmsetiology"[Mesh] OR"Stomach Neoplasms/ microbiology"[Mesh] OR"Stomach Neoplasms/pathology "[Mesh]OR Stomach Neoplasms/physiology"[Mesh]OR"Stomach Neoplasms/physiopathology"[Mesh])AND(HP"[TIAB] OR helicobacter[TIAB] OR VacA protein, Helicobacter pylori"[Supplementary Concept] oR"cagA protein, Helicobacter pylori"[Supplementary Concept] OR"Campylobacter pylori"[TIAB] OR PYLORI[TIAB]))OR ((Gastri[TIAB] OR Gastroe"[TIAB]OR Gastroi[TIAB] OR STOMACH[TI] OR FUNDUS[TI] OR CARDIA"[TI]) AND(cancer[TI] OR carcinoma[Tl] OR Neoplasms[TI] OR LYMPHOMAS[TI] OR Leiomyoma[TI] OR adenoma[Tl] OR schwannoma[ Ti] oR TUMOR[TI]) AND(HP"'[TI] OR helicobacter[ TI] oR"VacA protein, Helicobacter ylori "[Supplementary Concept]OR"cagA protein, Helicobacter pylori [Supplementary Concept] OR"Campylobacter pylori"[TI] OR PYLORI[ TID))AND ("2014/01/01"[PDat]:"2014/12/31[PDat]) 检出结果:检出记录数211篇,并填写3条相关文献题录: I Sena T ML, DAA, C WA Helicobacter pylori infection in gastric extranodal

t~t%-1,f, tf.) 11: ,tb1J!lhJfi*~, -it !):H*~~a *- 69 ;z1J}( 0 ti·;:; ~ -t #t.~ -tOf fA JlfJ 1.f, di1, ~t.i~. ~~Aa *-;zIJ}( 0 1. Pubmed t1t-tit~: (((( IHelicobacter/etiology"[Mesh] OR "Helicobacter/microbiology"[Mesh] OR "Helicobacter/pathogenicity"[Mesh] OR "Helicobacter/physiology"[Mesh] ) AND (Gastri*[TIAB] OR Gastroe*[TIAB] OR Gastroi*[TIAB] OR STOMACH[TIAB] OR FUNDUS[TIAB] OR CARDIA*[TIAB])AND (cancer[TIAB] OR carcinoma[TIAB] OR Neoplasms[TIAB] OR LYMPHOMAS[TIAB] OR Leiomyoma[TIAB] OR adenoma[TIAB] OR schwannoma[TIAB] OR TUMOR[TIAB])) OR (( "Stomach Neoplasms/etiology"[Mesh] OR "Stomach Neoplasms/microbiology"[Mesh] OR "Stomach Neoplasms/pathology"[Mesh] OR "Stomach Neoplasms/physiology"[Mesh] OR "Stomach Neoplasms/physiopathology"[Mesh] ) AND ("HPII [TIAB] OR helicobacter[TIAB] OR "VacA protein, Helicobacter pylori" [Supplementary Concept] OR "cagA protein, Helicobacter pylori" [Supplementary Concept] OR "Campylobacter pylori"[TIAB] OR PYLORI[TIABJ)) OR ((Gastri*[TIAB] OR Gastroe*[TIABj OR Gastroi*[TIAB] OR STOMACH [Tlj OR FUNDUS[Tlj OR CARDIA*[TI]) AND (cancer[TI] OR carcinoma[TI] OR Neoplasms[TI] OR LYMPHOMAS[TI] OR Leiomyoma[TI] OR adenoma[TIJ OR schwannoma[TI] OR TUMOR[TIJ) AND ("HP"[TIl OR helicobacter[TI] OR "VacA protein, Helicobacter pylori" [Supplementary Concept] OR "cagA protein, Helicobacter pylori" [Supplementary Concept] OR "Campylobacter pylori"[TI] OR PYLORI [TI]))) AND ( "2014/01/01"[PDat] : "2014/12/31"[PDatl )) [1J Sena T M L, D A A, C W A. Helicobacter pylori infection in gastric extranodal

marginal zone lymphoma of mucosa-associated lymphoid tissue( malt lymphoma a re-evaluation[].Gut,2014,63(9):1526-1527 [2] Chaturvedi R, Asim M, Piazuelo M B, et al. Activation of EGFR and ERBB2 by Helicobacter pylori results in survival of gastric epithelial cells with DNa damage [J] Gastroenterology, 2014, 146(7): 1739-1751 3 Derks S, Bass A J Mutational signatures in Helicobacter pylori-induced gastric cancer: lessons from new sequencing technologies[]. gastroenterology 2014,147(2):267-269 检索策略叙述: 在bed中运用me词搭配自由词的方法能能够查全同义词与子概念,并 能够保证查到比较新的文献与 medline朱收录的文献,这些方面课上已多次强 调,在此不作赘述 iMOLING 针对所选择的课题,我从三个大方面去检索 1.幽门螺杆菌的影响mesh] 先对幽门螺杆茵的№H词进行检索。通过粗看文献的文摘,我发 现有些学者在写文章的时候把幽门螺杄菌 Helicobacter pylori的概念放大 至螺杆菌 Helicobacter进行叙述,其实通篇讲的就是幽门螺杄茵,而且主 題词的标引人员有时也喜欢标螺杄菌下的副主题词而非幽门螺杄菌的 副主题词。为了不丢失这部分文件,我在幽门螺杆菌的上位词螺杆菌的 主题词下进行副主题词的选择:病因,微生物学,病理和生理。并且对 螺杆菌下的其他4个下位词进行补差,发现限定条件内不会检出干扰的 文献(其他4个下位词都是小概念),所以可以认为提高了查全度的同 时保住了查准度。 尔后再对胃"的概念进行限制。从解剖的角度把胃分为”贲门”,“幽 门”与胃底,保证查全度。其中由于代表胃”的名词比较多,如 gastric, Gastrointestinal等,我进行截词符的运算" gastro*”," gastro·和" gastre*” 这三个前缀能够在保证查准的同时囊括其他与胃相关的词 最后对“肿瘤”的概念限制,从组织学与病理学的角度把胃易发的肿 瘤分为腺癌,鳞癌,淋巴癌,再结合常见的肿瘤的名词进行限定。限定

marginal zone lymphoma of mucosa-associated lymphoid tissue (MALT) lymphoma: a re-evaluation[J]. Gut, 2014,63(9):1526-1527. [2] Chaturvedi R, Asim M, Piazuelo M B, et al. Activation of EGFR and ERBB2 by Helicobacter pylori results in survival of gastric epithelial cells with DNA damage[J]. Gastroenterology, 2014,146(7):1739-1751. [3] Derks 5, Bass A J. Mutational signatures in Helicobacter pylori-induced gastric cancer: lessons from new sequencing technologies[J]. Gastroenterology, 2014,147(2):267-269. ~. #t 1ftIfl3.~x. I!.:-',J/ f \' " .~€tftf ~ffl meshiaJ~iJjG mtbiaJ fl1 ;;;f*1i~1i~~ fiil X.ia] E] -tm~, * ~~1*jL jlJ ,~4HIi RIJ ;t'"'~~~J:.,jtRIJ ;;;f i~Ct. e.. ;ksi ""--"" iftJ, tf.tl:.~f1:f-I!.. - ~i MLv LIN c '. #~M~~fl1*., ~~~+k;;;f~~#ti? 1. fl *~ffiII fl1 JJuf.J [mesh] J~:1f q:~ ~~ j:.:tfl1 ff.H~.re.~ fl *.;#iII Helicobacter pylorifl1{lit~~tk .f.*~#iII Helicobacteritt-fT>l5tI!., $ ~iffi.;i;j#-a1 :M::Jt~ fl ~;lfiII 0 r7T11Li. Jl!ia] fl1 ~;f 51 A.. 91 :1f ut -t!:..-t- ~k~;f~;IfiII T a1t%1].i.Jl!ia] r7T1 4f 11 ~; # iII fl1 t%IJ .i.Jl!iaJ 0 7J 1 ~-!- l~~~x.1t, ~~~ fl ~;ffiII 61 J:1ftia] ~;lfiII fl1 .i.Jl!~Tittff~.i.Jl!~fl1~~: ~~, .~~ , ~m~~mo *A~ ~;# iII T fl1 $1~A+ T {iia] itt1T;f. , ;tJJ{!. Hut~1t 0] i'-~ l±: -t.fJL a1 x.rfJt ($~4+T1ftiaJ~Jt+m~) , PJfItA iifItAiA.7J~~ 1 ~±Jtfl1fiil ut1¥d.t 1 ~ift£o ;tIf; *~" WII fl1 {lit itt-fT f~ {jill. ~wr- ~l] fl1 mJt.re. W~:h "it 1'1", II ~ fl"1:;,11~, 1*-iiE.~±£o cftb-t1\~"Wf1fl1%.iaJ~t.4x.~, ~gastric, Gastrointestinal~, ~ittff~ iaJ #fl1~Jf:."gastroe*" f"gastroi*~"gastri*f1 ~~+~.~~tf.*iiE.~*fl1fiilutt~$~1:;,11~*fl1~. iilf; "JJtF "fl1 flit F~ t;tJ, ).J..tll ~Y- q: 1:;, MJJi. q: fl1 ffJ JiA~ 11 !h;t fl1 flf ~~:h ••, •• ,~~.,*~~~~fl1~~fl1%.~ittff~~. ~~ 6

到TIAB字段,在保证查全的同时提高查准率 2.胃肿瘤的产生机制@ 先对胃肿痛的MH词进行限定。相关的副主题词为病因,微生物 学,生理和病理 其次对幽门螺杄菌的概念进行限定。首先对幽门螺杆菌的凡个重要 补充概念进行选择,搭而esh,包括aca与ca日a这两个与幽门螺杆 茵和胃癌密切相关的蛋白作为补充概念。经过查阅《现代医学微生物学》 后,我发现一件有趣的事情,在上个世纪幽门螺杆茵是被划分到弯曲菌 的门下的,所以它的曾用名是 Campylobacter pylori.虽然现在用这个名 词的人应该不多了,但为了避免有些年长的学者依旧沿用这个旧称而造 成检索丢失,所以还是有必要把这个词也放到螺杆茵的概念下。并对学 者常用的对幽门螺杄菌的称呼进行整理,提炼出关键字进行对幽门螺杆 菌的限定。限定到TAB字段,在保证查全的同时提高查准率。 3.再对课題下的这两个概念进行自由词查全 就是对上面两步的自由词进行组合,并把原来限定的TIAB字段改为 ∏字段,减少全部使用自由词查询所带来的查询准度的降低 三、全文数据库 根据你的课题,如果需要尽快获取全文详细内容,可以选择全文数据库进行 直接检索。请在中国知网期刊全文数据库、维普中文科技期刊数据库、万方数据 资源数字化期刊群中任选一种检索。 数据库名称:中国知网期刊全文数据库 检索语句:(T%幽门螺杆菌RT%幽门螺旋杄菌RT‰ HP'OR T% Helicobacter OR TI%pylori OR TI%VAC OR TI% CAG OR TI%' Campylobacter pylori'OR TI%#1T 螺旋菌)AND(SU%胃癌'ORSU%胃瘤RSU%胃肿瘤'ORSU%胃淋巴癌'ORSU‰ 胃淋巴瘤ORSU%胃腺癌'ORSU'贲门/NEAR5癌'ORSU='幽门NEAR5癌'OR SU=门∧NEAR5瘤'ORSU='幽门∧NEAR5瘤'ORSU=胃/NEAR7瘤'OR SU=胃/NEAR7癌) AND YE=2014 检出结果:检出记录数146篇

fUTIAB5f:$!(, ;(f.-1%iiE.~~{r!J fiil at~ ;1f:£. 2 1I11t1tii6IJf'-:tMI~-\.~ ?t 1J Rf {r!J ~aJ*.4tftt!t. {fl -* {r!J ~lJ .i.~iaJ ;9 !til, 1tt1.Ah /if: , 1-.f:lf .f:lf • *ik~~ fl ~t-;ff~ {r!Jm~itfAtftt!t. 11 ?t~~ fl ~t-;ff~ a~ JL1'-3t~ ;f.f- Jt{!!i:t-iiHti2~At, 4~~e" [~c:~ ~A5vac a lj cag a~ J1.lj t-lj ~ fl ~t-# fp 1J4 -tJ){fl -* {r!J ~a 11;9 ;f.f-Jtm:t-. tiiii!J. Jll «JJtf.\('[! /if: 1tt1-4h/if:» J{;, $,.j(JJt-14-:1f,it{r!J '~,;(f....t t-t!t:"tG~ fl ~;ff~ Jt;ft~'j ~flJ db ~ a~ nr {r!J, pif~:A 't {r!J iW ffl itCampylobacter pylori. :l ~JJt;(f.ffl 1'-~ i~ a~A.B ii ~ 7 , 1!!1J 7 l!t>t;ff &:--+*a~ /if:~* 189ti ffl 1'-18 ;f*Ji7:t! A.~~ -k ~, pif y:Aifit:1f .;t.~.-re.~ t-i~ -t!!..itftl ~t-# {r!J tet~r. *~/if: ~'iIf ffl {r!J~~ fl ~;ff~ {r!J ~PfiZt1t1t.f:lf, ~1* tt: -*it5f: iZt1t~ n ~t-# a~ Ftt;t. ftt;tfIJTlAB~.ft, ;(f.-1%iiE. ~~{r!J fiil at~ ;1i4£.. 3. ~~*~r{r!J~J1.ljt-.:t-*ff~.~~~ :OCJt.~ ...t dO J1.lj -tV {r!J ~ .iaJ iZt1till.,*", *.-re.)jfd~;.Ftt!t {r!JTIAB~ .f1UtlJ Tl5f:a, A~~~~m~.~~~M.~{r!J~~*~{r!J~~ ..::.,~x.4t-#k4 t~~{r!J*~,~**~~~4~~x.#~~~,~~~*~x.4t-#k4iZtff A#~~. *;(f. tf 00~ra]J!J1f'J~X.tt-#k4, $'(t-ittf X.;f+~t$.}]fJJ4t-#k4, 7i~tttJ! -t~4t~1tJ!J1f'J~tf1£i1-#~~ • 4t-#k 4 ;f* : tf 00 :1;11 ra] J!J1 flj x.lt-#k 4 #l:-~i.g.6]: (( TI%'~ fl ~t-;ff~'OR TI%'~ fl ~t-;&k#~'OR TI%'HP'OR TI%'Helicobacter' OR TI%'pylori' OR TI%'VAC' OR TI%'CAG' OR TI%'Campylobacter pylori' OR TI%'~ fl ~;&k~') AND (SU%'1J4' OR SU%'1J1t'OR SU%'1J J1tF~' OR SU%'1J;:#.e...4' OR SU%' 1l;:#. e...1t 'OR SU%'1l1!Jlt~' OR SU='i!" fl /NEAR 5 ~'OR SU=' fl /NEAR 5 'OR SU='i!"fl /NEAR5 ~'ORSU='~fl /NEARS~' ORSU='1J /NEAR7 ~'OR SU='1J /NEAR 7 ')) AND YE=2014 7

填写3条相关题录: [1]胡洁,孙哲,梅林,幽门螺杄菌细胞毒导致胃癌发生的作用机制[.中国药 理学通报,2014,30(2)156-159 [2]师瑞,王钧.幽门螺杆菌相关 microRNA在胃癌中的作用U.胃肠病学, 2014,19(3):185-187 [3]王彬彬,张方信,马强.幽门螺旋杄菌介导的自噬与胃癌发生机制的研究进 展U世界华人消化杂志,2014(28):42944300 注:《世界华人消化杂志》是这个学科领域的优秀中文期刊,有大量和我这个课 题的契合度高的文章。但我搜索了一下这本杂志其他的文章也没有卷号的标引 可能这本杂志本身就没设置卷号,有待进一步考证。 检索策略叙述 先对检索的方法进行简单的分析 利用CNK期刊检索的专业检索,先对2014年涉及幽门螺杄菌的文章进行检 索,再在此范围内对涉及胃癌的文章进行限定 首先选择的幽门螺杆菌的这几个等价的名字是中国的学者们常用的,尤其是 HP这个简写,还包括了幽门螺杄菌的曾用名与幽门螺杄菌的错误简写(幽门螺 旋菌)此外将幽门螺杄菌的字段限定在篇名字段是为了能够提高查准率。因为 幽门螺杆菌的名词相对比较单一所以比较适合将它放在篇名字段里,避免漏检 其次限定胃癌的范围。胃癌的中文表达方式何其多,从组织学上讲分为鳞癌, 腺癌,平滑肌癌,从解剖部位上讲分为贲门癌,胃底癌,胃体癌,幽门癌。如果 用高级检索的方式一个一个去敲的话我觉得稍显冗余,而且很容易漏检,所以我 选择用专业检索的方式自己定义检索式。用了同勹的邻近算符来保证补漏检胃癌 的多种表达形式,也利用CNK自带的切分运算符%来进行查全。虽然粗略浏览 检索结釆后还是觉得检索结果还应该有进步的空间,但这已经比简单地用高级检 索妤多了。主要的问题在于CNK自带的模糊搜索与切分运算有点诡异,例如“胃 肿瘤"的模糊运算比“胃瘤”的结果多,这说明CNK的语句分割方式和我们日常理 解的分割方式不太一致,用起来有些费劲。 其实我觉得如果CNK能够把检索式统一整合把高级检索和专业检索结合起 来,像CBM和 PUBMED那样可以两个运算式一起用R语句运算就好了,可以

lA.ll 3 ~;ff.l --*M:;}t: [1] if] it, 1']-{1, ~tH,f.. n*'"# iii fu7 Jle. -* It W 1:tdt 1-f0 11 Jf] :fJL 1M [J]. tf I!l Pi J.! q:i!;fli, 2014,30(2): 156-159. [2) ~ifi~, .1..l~. n~# il;ff.l --* microRNA ,(f W tf f01t Jf] [J]. WM; #J q:, 2014,19(3):185-187. [3] .I.#;#;, n~.:lf1t, ~5i. n~f.jJt#il1t~f0 t.J 1tlj W~*-1-:fJL~lj f0ZJf~:itt Jll[J]. -t!!: %f-.if'.A.~)!j 1t~;t, 2014(28):4294-4300. ~:«-t!!:%f-.if'.A.~~~~»~~+q:#~~f0«*tf~~~, ~kt~~~+* ~~~~~~~.a~~I4~, ~#:itt-~~~. #i-i; *-wt~~: 7t~#i-i; f0:;f ~:itt-rt;al if-f0 ~;fJf 0 :;fIJJf] CNKI ~f'J#i-i; f0 -t 3f.#i-i;, 7t~ 2014 -f,'!V Jt~ f1 ~f.;ffil f0 ~-:t:itt-rt#i￾i;, ~,(f~~~~~~JtW~f0~-:t:ittff~~o il7ti!#-f0 fl SI",;ffil f0 ~JL+~11rf0 >t tf I!l f0 q:;;fff1 Jf] a~, A::.Jt>t HP ~+ialll, if @Ai51 f1 ~#il f0 Jf] lj fl ~f.;fff£f01h~;alll (~n ~f. ~il). ~;r*~fl~#ilf0~$tFtt~,(fJ;~~$t>tj; 1~~~$t~ *.$. rElj; n*"'#il f0~ i.iJ;fEl~ ftAx.if--P]fYA ftAx.:it~¥f't ~t,(fJ;~ ~$t.£, iEt~~;fft-. Jtikftt~ W:ffljf0~~ 0 W~f0 tf .:t.~lA:If ;\1i7fJt p, tAiiliR J:i*~j;~~, Ji%:fflj, -t;ffJlJL:fflj, tAm.%'J~1j:J:i*1}jr~fl~, WA~, W#'~, ~fl~. 110 * Jf] ~tft- i; f0 :If ;\- + - + 4;-;M. f0 iii #H~ 1& 'it.~, rffJ li-itt$. #; ~~ tft-, p]f YA ~ i!#-Jf] -t.:1k.tft-i; f0 :If ;\ t.J G x..tft-i; A.. Jf] 1 ~ GJ f0 4~ ilLJf-1f $dfdiE. I-5~ tft- W~ f0 #~lA1fJ;\, ~:;fIJJf] CNKI t.J *f0~J]1}:i£Jf-1f%*:itt-rt4i-~. :i ,~$wtij'l '!t tft-i;~*~if>t~~tft-*~*ifS~~:itt~f0~M,~~G~~~if-~Jf]~~tft­ *#~ 1 • £~f0I"';]M,(f -t CNKI ~ *a~;f~*#J;Jti; ljtJ]~:i£Jf-* ,f.>3feAf, 1fHo"W Hf1i¥iIlf0;f~;f#j:i£X-ft." W1i¥i"f0 *- ~, ita}) CNKI f0"* 6J ~$IJ:;f ;\~~11'1 El 'fJ.! m.f0~~:If;\~k-It, Jf]~~~~f~

大大提升检全度 q.引文检索(如 Web of science,中国知网期刊全文数据库等) 从本专业著名学者或经典论文出发,以文献的著者、题名或刊名等为被引信 息,来查找该著者或该论文被引用的情况。 数据库名称: Web of science 检索语句:被引作者:( PARSONNET〕AND被引著作:( NEW ENGLJ MED)AND被引 年份:(1991) 被引用文献题录(1条) [1] Parsonnet J, Friedman G D, Vandersteen dP, et al. helicobacter pylori Infection and the risk of gastric Carcinoma[J]. the New England Journal of Medicine 1991325(161127-1131别用文献题录(1条) [1 Blaser M J, Perez-PerezGL, Kleanthous H, et al. Infection with helicobacter pylori strains possessing cag A is associated with an increased risk of developing adenocarcinoma of the stomach [J]. Cancer Res 1995, 55(10): 2111-2115 检索策略分析 Web of science和其他的数据库相比有个非常不错的功能就是可以对检索出 来的文章进行有效的数据分析,比如被引数的高低,检索结果的分析与精炼等等。 所以在数据分析方面 web of science是远强于其他数据库的,这与它的开发公司 汤姆森科技信息集团的主攻方向是密不可分的,毕竟人家就是搞信息数据的。 所以在相对简单的检索之后我选择了 Parsonnet」的这篇高被引数的文章(被 引频次2792次)作为我这个课题领域的经典文章,再通过浏览引用这篇文章的 200多篇文献,确定了引用文献的题录。值得一提的这篇引用文献也是经典著 作之一,被引频次达到1043次,我认为沿着经典文章引用前人经典文章的这条 线来研究一个课题,能够很好地把握这个学科的发展路线,并对发展的方向有所 领悟

'lSI. 51 :i:.t1ti: (~o Web of Science, tf 1!J:1.0 /#] $}jf,J 1:-:i:.4t.t%4.;j- ) }.J...~ -t ~*" --t~;$- Ar~~1t:i:. tB:Ji.., vA :i:.ifK¥J *";$-, ~--t A f'J--t.;j- j;~Jt 511t .~ , *- ~~ -ii*";$-A -ii1t:i:.~Jt 51 JfJ ¥J ·~t ;JL 0 ft.t%4--t #: Web of Science t1ti:-i%GJ: ~Jt51 t'F;$-: (PARSONNET J) AND ~Jt51 *"11: (NEW ENGLJ MED) AND ~Jt51 If-17i": (1991) ~Jt51 JfJ j:ifK~:1t (1;}-): [1] Parsonnet J, Friedman G D, Vandersteen D P, et al. Helicobacter pylori Infection and the Risk of Gastric Carcinoma[J]. The New England Journal of Medicine, 1991,325(16):1127-1131., IJfJ :i:.ifK~:1t ( 1 ;}- ): [1] Blaser M J, Perez-Perez G I, Kleanthous H, et al. Infection with Helicobacter pylori strains possessing cagA is associated with an increased risk of developing adenocarcinoma of the stomach[J]. Cancer Res, 1995,55(10):2111-2115. Web of science :;fo$.-11t¥J 4t.t% 4 {EHt.;ff 1'-~f '* ;f:4t¥J 1it:M.~ or vA ~t1ti: tB *- ¥J :i:.-titt1-r;ff?1t ¥J 4t.t% jj--{Jf, ~t. ~;fJt 51 4t fIJ lL%., t1t i: rt *- ¥J jj--{Jf1=; ~k )* .;j-.;j- 0 pJfvA{fAt.t%jj--{Jf~ Ui1 web of science ~izt.5~ -t $.-1~4t.t%4 61, i!1=; 't ¥J 1f:Ji../~~ ~.A#~~~.OO¥J~~~~~.;f:orjj--¥J, ~~A~:M.~~~~• .t%¥Jo foJfvA{f{El~ f.fj -1-¥Jt1ti: ZJ6 ~1&# T ParsonnetJ fIJ i!~ ~~Jt 514t61 :i:.-t( ;fJt 51 #i;]( 2792 ;]( ) t'F j; i!1'-i*~49i j~ fIJ r~.¢.. :i:.-t, 1tif!i:Uj'j l31 JfJ i!~ :i:.-t 61 2000 J. ~:i:.ifK, :l>ftJ T 51 JfJ :i:.ifK ¥J~:1to 11i.1Jf--tt¥J i!~ 51 JfJ :i:.ifK.e.~r~~*" 9

五.网络信息检索 1.与课题专业相关的医学网站 检索与课题内容相关的专业网站,从这些网站中可以获取专业新闻、重要 的专业电子期刊、专业使用的参考工具、讨论组等信息。专业学会、协会的网站, 通常是重要的专业网站。这些专业的网站信息具有新颖性、专业性、交互性强的 特点。写出网站名称及网址: O American Gastroenterological Association http://www.gastro.org/join-or-renew/join-aga/physician-scientists/international physician-scientists 美国胃肠病学会(AGA的网站,是胃肠学领域的重要专业协会网站。胃肠学的 顶级杂志 Gastroenterology是AGA发行的,所以有必要吋常关注这个学会,把握 最新的研究动向。而且在 research板块里有不少最新的研究成果,网站上也有最 近的研讨会活动等等 毕竟现在美国还是走在医学领域的前沿的,所以我认为AGA的官网是一个胃 肠学学者必不可少的关注网站。 ②中华消化网 http://www.csge.org/ 和美国的AGA类似,中国的消化学会的主网站。网站的主要内容有最新的 研究成果公布,翻看纪录发现中华消化网几乎毎天都有新的研究内容更新。此外 网站的内容还有消化学会的一些行业内的共识规范,最新的学术会议信息,甚至 还有一些公开课的视频 总的来讲我觉得中华消化网的内容还是很丰富很实用的,不失为一个平常逛 逛的选择 Johns Hopkins Gastroenterology and Hepatology http://www.hopkinsmedicine.org/gastroenterologyhepatology 约输霍普金斯名下的一些胃肠医学机构合在一起的网站,介绍了下属的各个 消代学相关的医疗机构。有面向病人的方面,比如“ find a doctor"板块与" request an appointment”板块,也有面向医学生的" educational and training”板块。 如果有意象出去交流或者考U的话,我认为这个网站上的内容可以起到一定的

1. ~i*J! -t ~{~ *-fA 1ft fAAl gl; ~~~~M~~~*-fA-t~fAAlM, ~~~fAAlMt~~~~-t~~~. t~ fA -t tt!. 1-J1}Jf,J, -t 1tJfl fA %t:t .:L-J!., it~fll. ¥-1t It" -t ~, tfJ.~a1 fAAl gl;, ~~~~~fA-t~~M. -t~fAfAAlM~~~~~M~,-t~~,~§~GfA 4+.*-" tl:: ~gl;~#llfAAlJtl:: CD American Gastroenterological Association http://www.gastro.org/join-or-renew/join-aga/physician-scientists/international￾physician-scientists ~OOW%~~~~G~fAfAAlM,~W%~~~fA~~-t~~~fAAlM. W%~fA TJi~*.t Gastroenterology AGA ~.AtfA, PjfvA~ .)l.·~fft~ *-).i~t-~~, .:re.-t§. itt.§jfa1ZJfJt iJJ foL r1i1 J1..1l. research ffi..1k.JR~ ;;r:.;,- ii§jf a1 ZJfJtA~)fC fAAl ;:1l;J:.e.~ itt. ilt.fA ZJfit ~~-5 iJJ ¥- . . ~~~1l.~~~~k1l.Ift~~~fA~~~,ffl~~R~AGA~~~~-t-W :t.)Q ;;r: .;,' fA *- fAAl gl;. http://www.csge.org/ ~~~fA~A~~, tOOfA~~~~~~fAAlM. fAAlMfA~~~~~ii~fA ZJfJtA~~*,.~~~L~t~~~fAAl~+*~.~~~~Jt~~~~.~* fAAlMfA~~~~~~~~fA-~ff~~fA~~~~,itt.~fA~~~~~&,~£ ~~-~~-Jh*fAiJt~. ,ff, fA *--i#-~ 1tff t ~}f!j 1tfAAl fA ~ ~~~1!t.:f 1;1!t Jfl fA, ;r;: ~~ -1'---t~~ ~fAit#-o ® Johns Hopkins Gastroenterology and Hepatology http://www.hopkinsmedicine.org/gastroenterology _hepatology/ ~'M 1t fEl *- fA ~:ft :Vl.:#:}. riJ foJ A fA if riJ, 1:1::, -ka"find a doctor" ffi..i.k: "request an appointment" ffi..1k., .e.~ riJ foJ 1- a1"educational and training" ffi..1k.. ~*~~~tl::~~~A*:tUfA~, ~R~~t-fAAlMJ:fA~~~~~~-~~ 10