内蒙古科技大学：《生物信息学》课程f考试试卷A卷2009

内蒙古科技大学2009/2010学年第一学期 A.BLASTn B.BLASTp C.tBLASTn D.BLASTx 《生物信息学》考试试题 4.构建系统发生树，应使用： 课程号：66149304 考试方式：开卷 A.BLAST B.FASTA C.UPGMA D.Entrez 使用专业、年级：生技06，生工07任课教师：蔡禄 5.美国国家生物技术中心简称： 考试时间：2009年1月8日 备注：A卷 A.SIB B.EBI C.NCBI D.MIPS 一、名词解释（共5题，每题3分，共15分） 四、问答题（共3题，每题5分，共15分） 1.序列比对 2.基序(moti) 3.表达序列标签(EST) 1.解释正则表达式C-Y-X2-DGG-X-ST可的含义 4.电子克隆 5.开放阅读框(ORF) 2.构建蛋白质二级数据库的主要方法有哪些？ 二、填空题（共6愿，每空1分，共20分） 3.总结基因融合法预测蛋白质相互作用的基本原理。 1,目前国际上最常用的核酸序列数据库有」 和 五、计算题（共3愿，共40分） 2.目前回际上最常用的蛋白序列数据库有」 和 L.对两个序列ACACACTA和AGCACACA进行全局比对。(10分) 3.列举至少五种NCBI的服务项目 2.对于下列距离矩阵，用UPGMA构建系统发生树。(10分) 和 等。 A B C D E 4.蛋白质得分矩阵类型有等价矩阵、 和 A 0 等。 B 3 0 0 5.预测蛋白质-蛋白质相互作用的理论方法主要有 100 和 一等。 E 1211 1390 6.对位排列主要有局部比对和 3.对下面距离矩阵，用邻近归并法构建系统发生树。(20分) 三、单项选择愿（共5愿，每愿2分，共10分） A B 1.如果我们试图做蛋白质亚细胞定位分析，应使用 A 0 A.NDB数据库 B.SWISS-PROT数据库 B 0 C.GenBank数据库D.PDB数据库 C 0 . 2.Profiles数据库是 D E A.蛋白质序列数据库B.核酸序列数据库 C.蛋白质二级数据库D.蛋白质结构数据库 3.在蛋白质序列数据库中比较查询蛋白质序列，应使用 第1页共1页

第 1 页 共 1 页 内蒙古科技大学 2009/2010 学年第一学期 《生物信息学》考试试题 课程号：66149304 考试方式：开卷 使用专业、年级：生技 06，生工 07 任课教师：蔡禄 考试时间：2009 年 1 月 8 日 备 注： A 卷 一、名词解释（共 5 题，每题 3 分，共 15 分） 1. 序列比对 2. 基序（motif） 3. 表达序列标签（EST） 4. 电子克隆 5.开放阅读框（ORF） 二、填空题（共 6 题，每空 1 分，共 20 分） 1. 目前国际上最常用的核酸序列数据库有 、 和 。 2. 目前国际上最常用的蛋白序列数据库有 、 和 。 3. 列举至少五种 NCBI 的服务项目 、 、 、 和 等。 4. 蛋白质得分矩阵类型有等价矩阵 、 、 、 和 等。 5. 预测蛋白质-蛋白质相互作用的理论方法主要有 、 、 和 等。 6. 对位排列主要有局部比对和 。 三、单项选择题（共 5 题，每题 2 分，共 10 分） 1. 如果我们试图做蛋白质亚细胞定位分析，应使用 A. NDB 数据库 B. SWISS-PROT 数据库 C. GenBank 数据库 D. PDB 数据库 2. Profiles 数据库是 A. 蛋白质序列数据库 B. 核酸序列数据库 C. 蛋白质二级数据库 D. 蛋白质结构数据库 3. 在蛋白质序列数据库中比较查询蛋白质序列，应使用 学生班级_学生学号：□□□□□□□□□□□□学生姓名：_ .装订线.装订线.装订线.试卷须与答题纸一并交监考教师.装订线.装订线.装订线. A. BLASTn B. BLASTp C. tBLASTn D. BLASTx 4. 构建系统发生树，应使用： A. BLAST B. FASTA C. UPGMA D. Entrez 5. 美国国家生物技术中心简称： A. SIB B. EBI C. NCBI D. MIPS 四、问答题（共 3 题，每题 5 分，共 15 分） 1. 解释正则表达式 C-Y-X2-[DG]-G-X-[ST]的含义 2. 构建蛋白质二级数据库的主要方法有哪些? 3. 总结基因融合法预测蛋白质相互作用的基本原理。 五、计算题（共 3 题，共 40 分） 1. 对两个序列 ACACACTA 和 AGCACACA 进行全局比对。（10 分） 2. 对于下列距离矩阵，用 UPGMA 构建系统发生树。（10 分） A B C D E A 0 B 3 0 C 6 5 0 D 9 9 10 0 E 12 11 13 9 0 3. 对下面距离矩阵，用邻近归并法构建系统发生树。（20 分） A B C D E F A 0 5 4 7 6 8 B 0 7 10 9 11 C 0 7 6 8 D 0 5 9 E 0 8 F 0