四川农业大学：《家畜育种学 Farm Animal Breeding》课程教学资源（PPT课件）第七章 个体遗传评定（BLUP法简介）

第七章”个体遗传评定 BLUP法简介 BLUP方法是美国学者 Henderson于1948年提出的, 由于这种方法涉及到大量的计算,由于当时计算条件 的限制 ·到20世纪80年代,随着数理统计学尤其是线性模型理 论、计算机科学、计算数学等多学科领域的迅速发展, BLUP法在估计家畜育种值方面才得到了广泛应用,特 别是在大家畜的种用价值评定方面,为畜禽重要经济 性状的遗传改良作出了重大贡献

第七章 个体遗传评定 ——BLUP法简介 •BLUP方法是美国学者Henderson于1948年提出的， 由于这种方法涉及到大量的计算，由于当时计算条件 的限制 •到20世纪80年代，随着数理统计学尤其是线性模型理 论、计算机科学、计算数学等多学科领域的迅速发展， BLUP法在估计家畜育种值方面才得到了广泛应用，特 别是在大家畜的种用价值评定方面，为畜禽重要经济 性状的遗传改良作出了重大贡献

、BLUP的概念及数学模型 )BLUP的概念 BLUP— Best Linear Unbiased Prediction,即 最佳线性无偏预测。按照最佳线性无偏的原则去估 计线性模型中的固定效应和随机效应。 线性是指估计值是观测值的线性函数; 无偏是指估计值的数学期望等于被估计量的真实值(固定 效应)或被估计量的数学期望(随机效应); 最佳是指估计值的误差方差最小

一、BLUP的概念及数学模型 （一）BLUP的概念  BLUP——Best Linear Unbiased Prediction，即 最佳线性无偏预测。按照最佳线性无偏的原则去估 计线性模型中的固定效应和随机效应。  线性是指估计值是观测值的线性函数；  无偏是指估计值的数学期望等于被估计量的真实值（固定 效应）或被估计量的数学期望（随机效应）；  最佳是指估计值的误差方差最小

(二)BLUP的数学模型 ■根据BLUP的定义,所用数学模型为线性模 型——模型中所包含的各因子是以相加的形 式影响观察值,相互间呈线性相关。 ■线性模型的构成: 数学方程式 方程中随机变量的期望方差和协方差 假设及约束条件等

（二）BLUP的数学模型  根据BLUP的定义，所用数学模型为线性模 型——模型中所包含的各因子是以相加的形 式影响观察值，相互间呈线性相关。  线性模型的构成：  数学方程式  方程中随机变量的期望方差和协方差  假设及约束条件等

线性模型的种类 n按功能可分为: 回归模型、方差分析模型、协方差分析模型和方 差组份模型。 按因子数可分为: 单因子模型、双因子模型和多因子模型 ■按因子性质可分为 固定效应模型、随机效应模型和混合效应模型

线性模型的种类  按功能可分为：  回归模型、方差分析模型、协方差分析模型和方 差组份模型。  按因子数可分为：  单因子模型、双因子模型和多因子模型。  按因子性质可分为：  固定效应模型、随机效应模型和混合效应模型

BLUP的实质 ■BLUP所使用的数学模型是混合效应模型 BLUP的实质是选择指数法的推广,但它有别 于选择指数法 n它可以在估计育种值的同时对系统环境误差 进行估计和矫正,因而,在传统育种值估计 的假设不成立的情况下,其估计值也具有理 想值的性质。 ■BLUP法唯一的缺点是受计算条件的限制

BLUP的实质  BLUP所使用的数学模型是混合效应模型  BLUP的实质是选择指数法的推广，但它有别 于选择指数法  它可以在估计育种值的同时对系统环境误差 进行估计和矫正，因而，在传统育种值估计 的假设不成立的情况下，其估计值也具有理 想值的性质。  BLUP法唯一的缺点是受计算条件的限制

BLUP法的基本原理——自学 、BLUP育种值估计的方法—自学 (一)无重复观察值的动物模型BLUP (二)有重复观察值的动物模型BLUP (三)其它模型下的BLUP (四)多性状的BLUP育种值估计

 二、BLUP法的基本原理——自学  三、BLUP育种值估计的方法——自学  （一）无重复观察值的动物模型BLUP  （二）有重复观察值的动物模型BLUP  （三）其它模型下的BLUP  （四）多性状的BLUP育种值估计